RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521865.5

PABPC1-218, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2

Gene PABPC1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-218ENST00000521865 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 DPYSQ14117 519 aa20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 SMTNL2Q2TAL5 461 aa20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 AMZ1Q400G9 498 aa20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 USP53Q70EK8 1073 aa20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 HEATR4Q86WZ0 1026 aa20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 PELI3Q8N2H9 469 aa20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 TMEM159Q96B96 161 aa20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 TRIM11Q96F44 468 aa20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 COQ10AQ96MF6 247 aa20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.87■□□□□ 0.93
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PABPC1-218ENST00000521865 B8ZZF3 427 aa20.86■□□□□ 0.93
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PABPC1-218ENST00000521865 VIPR1P32241 457 aa20.86■□□□□ 0.93
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PABPC1-218ENST00000521865 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa20.86■□□□□ 0.93
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PABPC1-218ENST00000521865 KCTD5Q9NXV2 234 aa20.86■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 CFAP46Q8IYW2 2715 aa20.85■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa20.85■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.934e-56■■□□□ 12.8
PABPC1-218ENST00000521865 PRAMEF10O60809 474 aa20.85■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 MYBL1P10243 752 aa20.85■□□□□ 0.93
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PABPC1-218ENST00000521865 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 KRT10P13645 584 aa20.85■□□□□ 0.93
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PABPC1-218ENST00000521865 PCK1P35558 622 aa20.85■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 ETV3P41162 512 aa20.85■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 GNPDA1P46926 289 aa20.85■□□□□ 0.93
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PABPC1-218ENST00000521865 RAET1GQ6H3X3 334 aa20.85■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 PIM3Q86V86 326 aa20.85■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.85■□□□□ 0.93
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PABPC1-218ENST00000521865 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.85■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa20.85■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 ZW10O43264 779 aa20.84■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 EFSO43281 561 aa20.84■□□□□ 0.93
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PABPC1-218ENST00000521865 MBD3O95983 291 aa20.84■□□□□ 0.93
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PABPC1-218ENST00000521865 IL1R2P27930 398 aa20.83■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 SERPINB6P35237 376 aa20.83■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 ETV5P41161 510 aa20.83■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 OR1D5P58170 312 aa20.83■□□□□ 0.93
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PABPC1-218ENST00000521865 TMEM164Q5U3C3 297 aa20.83■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 DOK6Q6PKX4 331 aa20.83■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 SLC30A9Q6PML9 568 aa20.83■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 USP45Q70EL2 814 aa20.83■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa20.83■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.83■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.83■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.83■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 SLITRK4Q8IW52 837 aa20.83■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 PGBD5Q8N414 524 aa20.83■□□□□ 0.93
PABPC1-218ENST00000521865 GPBAR1Q8TDU6 330 aa20.83■□□□□ 0.93
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