RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 RPL26P61254 145 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 SKOR1P84550 965 aa15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 PTK2BQ14289 1009 aa15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 IRF4Q15306 451 aa15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 RPS6KA1Q15418 735 aa15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC70Q6NSX1 233 aa15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 PID1Q7Z2X4 250 aa15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 TRIM58Q8NG06 486 aa15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 PIH1D2Q8WWB5 315 aa15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 CENPTQ96BT3 561 aa15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 TEKT5Q96M29 485 aa15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 ADGRE3Q9BY15 652 aa15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 KCTD5Q9NXV2 234 aa15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 A0A0J9YYE9 177 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 PCDHGA12O60330 932 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 FZD6O60353 706 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 TRBC1P01850 177 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 PCCBP05166 539 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 ALPIP09923 528 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 RBP3P10745 1247 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 RXRGP48443 463 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 YPEL5P62699 121 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 AGERQ15109 404 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 CNGA3Q16281 694 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 PCSK7Q16549 785 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 WSCD2Q2TBF2 565 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 DBX2Q6ZNG2 339 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 MARCH9Q86YJ5 346 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 IFT43Q96FT9 208 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 HERPUD2Q9BSE4 406 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 DNAJC28Q9NX36 388 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 TOR4AQ9NXH8 423 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 TRHDEQ9UKU6 1024 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 PPIL1Q9Y3C6 166 aa15.47■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 PSMD11O00231 422 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 MMP2P08253 660 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF30P17039 623 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 NFKB1P19838 968 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 RBL1P28749 1068 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 HNF1BP35680 557 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 GRK6P43250 576 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 PFN3P60673 137 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 WASHC5Q12768 1159 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 MTM1Q13496 603 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC14A2Q15849 920 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 MEI1Q5TIA1 1274 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 KDELC2Q7Z4H8 507 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 PARGQ86W56 976 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 GATAD2AQ86YP4 633 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 NUS1Q96E22 293 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM118BQ9BPY3 351 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 RSPH14Q9UHP6 348 aa15.46■□□□□ 0.07
TSNARE1-206ENST00000520462 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 CAPN8A6NHC0 703 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 H3BM21 787 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 KCNN4O15554 427 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 ZSCAN12O43309 604 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 TNFSF14O43557 240 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 PMPCBO75439 489 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 LHCGRP22888 699 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 HTR1BP28222 390 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 CDK18Q07002 472 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 IHHQ14623 411 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 INPP5AQ14642 412 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 HS1BP3Q53T59 392 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM182AQ5T1J6 154 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF567Q8N184 647 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 ATL2Q8NHH9 583 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 SPATA22Q8NHS9 363 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 COQ10AQ96MF6 247 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 C10orf88Q9H8K7 445 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM153AQ9UHL3 310 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 RAXQ9Y2V3 346 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 GPSM3Q9Y4H4 160 aa15.45■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM149AA5PLN7 773 aa15.44■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 GOLGA6CA6NDK9 693 aa15.44■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 GOLGA6BA6NDN3 693 aa15.44■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.44■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 SDC3O75056 442 aa15.44■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 PRLP01236 227 aa15.44■□□□□ 0.06
TSNARE1-206ENST00000520462 GOLGA6DP0CG33 693 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms