RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 KBTBD3Q8NAB2 608 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-206ENST00000467748 SECTM1Q8WVN6 248 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF570Q96NI8 536 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-206ENST00000467748 TKTL2Q9H0I9 626 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNN2Q9H2S1 579 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-206ENST00000467748 MAGEE1Q9HCI5 957 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF224Q9NZL3 707 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-206ENST00000467748 RCOR1Q9UKL0 485 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-206ENST00000467748 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-206ENST00000467748 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-206ENST00000467748 SHANK2Q9UPX8 1470 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-206ENST00000467748 KDM5BQ9UGL1 1544 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-206ENST00000467748 NHSL1Q5SYE7 1610 aa4.09□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A0G2JPF8 293 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 SNAP23O00161 211 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 BMPR1BO00238 502 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 LINC01565O15544 149 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 KRT36O76013 467 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 GAGE7O76087 117 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 WIZO95785 1651 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 GAGE12FP0CL80 117 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 GAGE12GP0CL81 117 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 GAGE12IP0CL82 117 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 AGAP20933 346 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 STX2P32856 288 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 SHMT1P34896 483 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF132P52740 706 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 UFM1P61960 85 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 GALNT2Q10471 571 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 GAGE1Q13065 139 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 GAGE4Q13068 117 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 NEDD9Q14511 834 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 C9orf139Q6ZV77 190 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 TUBA1AQ71U36 451 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 ODF3L1Q8IXM7 274 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 NAGSQ8N159 534 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 NR4A3Q92570 626 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 CD101Q93033 1021 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 FBXL8Q96CD0 374 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 TUBA1CQ9BQE3 449 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 UACAQ9BZF9 1416 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 SPRY4Q9C004 299 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 EVA1AQ9H8M9 152 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 CNGB3Q9NQW8 809 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 SAGE1Q9NXZ1 904 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 C1RLQ9NZP8 487 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 SIX4Q9UIU6 781 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM96BQ9Y3D0 163 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 CEP350Q5VT06 3117 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 RGS12O14924 1447 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 TNIKQ9UKE5 1360 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 KRT86O43790 486 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 LMX1BO60663 402 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 MMP2P08253 660 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 DGKAP23743 735 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 CHATP28329 748 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 DDIT3P35638 169 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 FUT6P51993 359 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC20A2Q08357 652 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 BIRC3Q13489 604 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 TNFAIP1Q13829 316 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 KRT81Q14533 505 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP2R5BQ15173 497 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 LCTLQ6UWM7 567 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 TMPRSS12Q86WS5 348 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 SCCPDHQ8NBX0 429 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 AGBL3Q8NEM8 1001 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM19Q96HH6 336 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 KLHL15Q96M94 604 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 PSMD1Q99460 953 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 KXD1Q9BQD3 176 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 CSTL1Q9H114 145 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 LUZP4Q9P127 313 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF711Q9Y462 761 aa4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms