RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 DENND5AQ6IQ26 1287 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 TICAM1Q8IUC6 712 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 PTERQ96BW5 349 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 TCF12Q99081 682 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 DGKBQ9Y6T7 804 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 SOAT2O75908 522 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 FASP25445 335 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC7A1P30825 629 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 FMO4P31512 558 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM207Q6UWW9 146 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 FUNDC1Q8IVP5 155 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 TWIST2Q8WVJ9 160 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 DGCR6LQ9BY27 220 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 CXorf21Q9HAI6 301 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 CNGB3Q9NQW8 809 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 TARM1B6A8C7 271 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 SNAP29O95721 258 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 THP07101 528 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 NFKBIAP25963 317 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 RBBP7Q16576 425 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 CLEC4FQ8N1N0 589 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 PSMG2Q969U7 264 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRJ-202ENST00000440289 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 KATNA1O75449 491 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CNTN5O94779 1100 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ATE1O95260 518 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ELK4P28324 431 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 PIK3CGP48736 1102 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 GNA12Q03113 381 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 APOFQ13790 326 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ISL2Q96A47 359 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ISOC1Q96CN7 298 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 PPM1MQ96MI6 270 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 SPON2Q9BUD6 331 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 GDAP2Q9NXN4 497 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 FADS3Q9Y5Q0 445 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 MAFKO60675 156 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 HADHAP40939 763 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 IST1P53990 364 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 LSM3P62310 102 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 EFEMP1Q12805 493 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 INPP5AQ14642 412 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 MFSD10Q14728 455 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 DDR2Q16832 855 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 IMPG1Q17R60 797 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 NT5C3BQ969T7 300 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 SMARCD1Q96GM5 515 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 NOL3O60936 208 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CD247P20963 164 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 GPR15P49685 360 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 PMS2P3Q13401 168 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 PTPRRQ15256 657 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 AAK1Q2M2I8 961 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 VAT1Q99536 393 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF385DQ9H6B1 395 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 AP1G1O43747 822 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 AGTR2P50052 363 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 PRKAA2P54646 552 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 POU4F1Q01851 419 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 SGO1Q5FBB7 561 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 UBXN11Q5T124 520 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 CFAP52Q8N1V2 620 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 SGCDQ92629 289 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 HMCESQ96FZ2 354 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF597Q96LX8 424 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A087X1B8 175 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 NPHS1O60500 1241 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 F9P00740 461 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 PHEXP78562 749 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 BFSP2Q13515 415 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 LAPTM5Q13571 262 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 TLK2Q86UE8 772 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 SNX29P2Q8IUI4 249 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC15A3Q8IY34 581 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 MIER2Q8N344 545 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 EFHBQ8N7U6 833 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 BHMTQ93088 406 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 RMDN1Q96DB5 314 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 TEX37Q96LM6 180 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-202ENST00000440289 BPIFA1Q9NP55 256 aa18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms