RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434982.2

ANKRD55-202, Transcript of ankyrin repeat domain 55, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD55, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55-202ENST00000434982 AMPD1P23109 780 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 ARNTP27540 789 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 UBASH3AP57075 661 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TPM4P67936 248 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 SEMG2Q02383 582 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 CYP4F3Q08477 520 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 FZD2Q14332 565 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 SETDB1Q15047 1291 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 C19orf48Q6RUI8 117 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 RFX8Q6ZV50 586 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 VPS36Q86VN1 386 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 RNF214Q8ND24 703 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 CXorf40AQ8TE69 158 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 RAB7BQ96AH8 199 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 EDEM3Q9BZQ6 932 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 ZWILCHQ9H900 591 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 PDFQ9HBH1 243 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TRPM6Q9BX84 2022 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 ARHGAP42A6NI28 874 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 DFFAO00273 331 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 AREL1O15033 823 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 RRP9O43818 475 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 PRAMEF11O60813 436 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 LRCH4O75427 683 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 PIAS2O75928 621 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TM7SF2O76062 418 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 PRKCGP05129 697 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 GIMD1P0DJR0 217 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 XPAP23025 273 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 HTR7P34969 479 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 PBX1P40424 430 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 RABIFP47224 123 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 RGRP47804 291 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 NDST2P52849 883 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 SMTNL2Q2TAL5 461 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 FIGNQ5HY92 759 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 HES3Q5TGS1 186 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TMPRSS12Q86WS5 348 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 CAMK1DQ8IU85 385 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 NPWQ8N729 165 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 HSPH1Q92598 858 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 THAP2Q9H0W7 228 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 ISCUQ9H1K1 167 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 RAXQ9Y2V3 346 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 SCINQ9Y6U3 715 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 ZZEF1O43149 2961 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 A0A1W2PQJ5 194 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 PALMO75781 387 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 CSF2P04141 144 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 PTMAP06454 111 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 C1SP09871 688 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 MYBL1P10243 752 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ACP1P24666 158 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 IL1R2P27930 398 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 HNF1BP35680 557 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 IGFALSP35858 605 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 GSTM4Q03013 218 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 C1orf61Q13536 156 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 AFMIDQ63HM1 303 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 SRLQ86TD4 932 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 PARGQ86W56 976 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 RBFAQ8N0V3 343 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 OR4C6Q8NH72 309 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 LMX1AQ8TE12 382 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ASB12Q8WXK4 309 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 CENPTQ96BT3 561 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 ARHGEF26Q96DR7 871 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 TRIM11Q96F44 468 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD55-202ENST00000434982 APOLD1Q96LR9 279 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms