RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
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PTPRU-204ENST00000428026 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRU-204ENST00000428026 ACOX1Q15067 660 aa14.51□□□□□ -0.09
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PTPRU-204ENST00000428026 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
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PTPRU-204ENST00000428026 C12orf56Q8IXR9 622 aa14.51□□□□□ -0.09
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PTPRU-204ENST00000428026 PCDHB18PQ96TA0 734 aa14.5□□□□□ -0.09
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PTPRU-204ENST00000428026 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRU-204ENST00000428026 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRU-204ENST00000428026 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.5□□□□□ -0.09
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PTPRU-204ENST00000428026 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRU-204ENST00000428026 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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PTPRU-204ENST00000428026 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
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PTPRU-204ENST00000428026 RECQL4O94761 1208 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRU-204ENST00000428026 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRU-204ENST00000428026 DEF8Q6ZN54 512 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRU-204ENST00000428026 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRU-204ENST00000428026 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRU-204ENST00000428026 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRU-204ENST00000428026 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRU-204ENST00000428026 AQP1P29972 269 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRU-204ENST00000428026 HNF4AP41235 474 aa14.49□□□□□ -0.09
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