RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ABL2P42684 1182 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CCR10P46092 362 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 POLD2P49005 469 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RASSF2P50749 326 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CLCN5P51795 746 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RHOAP61586 193 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LAMB3Q13751 1172 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PTPRRQ15256 657 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 HECTD2Q5U5R9 776 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TREML4Q6UXN2 200 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC149Q6ZUS6 474 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ASRGL1Q7L266 308 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 APCDD1Q8J025 514 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM151AQ8N4L1 468 aa3.99□□□□□ -1.77
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LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF781Q8N8C0 355 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 OR6K2Q8NGY2 324 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4L1Q8NH43 312 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC8Q8TAM2 541 aa3.99□□□□□ -1.77
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LRRTM4-201ENST00000409088 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GCNAQ96QF7 691 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIB3Q96RU7 358 aa3.99□□□□□ -1.77
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LRRTM4-201ENST00000409088 GPAMQ9HCL2 828 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 BPIFA1Q9NP55 256 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ASAH2Q9NR71 780 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGEF3Q9NR81 526 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 OXSMQ9NWU1 459 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa3.99□□□□□ -1.77
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LRRTM4-201ENST00000409088 MID2Q9UJV3 735 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 STOML2Q9UJZ1 356 aa3.99□□□□□ -1.77
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LRRTM4-201ENST00000409088 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 NEMP2A6NFY4 417 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 C2orf81A6NN90 581 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD66B4E2M5 251 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 DLX3O60479 287 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 DIAPH2O60879 1101 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CRTAMO95727 393 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LATS1O95835 1130 aa3.99□□□□□ -1.77
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LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00271P0C7V0 271 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 EN2P19622 333 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 IGFBP4P22692 258 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CPA2P48052 419 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GRIA4P48058 902 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CSRP3P50461 194 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 EPHB1P54762 984 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
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LRRTM4-201ENST00000409088 RCN2Q14257 317 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CFAP157Q5JU67 520 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PPM1LQ5SGD2 360 aa3.99□□□□□ -1.77
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LRRTM4-201ENST00000409088 ZYG11AQ6WRX3 759 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
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LRRTM4-201ENST00000409088 NSL1Q96IY1 281 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR78Q96P69 363 aa3.99□□□□□ -1.77
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LRRTM4-201ENST00000409088 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC3Q9BY71 257 aa3.99□□□□□ -1.77
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LRRTM4-201ENST00000409088 CATSPERZQ9NTU4 200 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MAFFQ9ULX9 164 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CLEC4EQ9ULY5 219 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa3.99□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A087X1B8 175 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 LEFTY2O00292 366 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 BNIP3LO60238 219 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC22O60826 627 aa3.98□□□□□ -1.77
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