RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
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SPHK1-201ENST00000323374 AFTPHQ6ULP2 937 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF783Q6ZMS7 281 aa21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
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SPHK1-201ENST00000323374 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF385DQ9H6B1 395 aa21.76■■□□□ 1.07
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SPHK1-201ENST00000323374 SULT2A1Q06520 285 aa21.75■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 PGM2L1Q6PCE3 622 aa21.75■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 OR4K2Q8NGD2 314 aa21.75■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 SH3RF2Q8TEC5 729 aa21.75■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
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SPHK1-201ENST00000323374 CD1DP15813 335 aa21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 EPHB3P54753 998 aa21.74■■□□□ 1.07
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SPHK1-201ENST00000323374 ARF5P84085 180 aa21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
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SPHK1-201ENST00000323374 LPCAT1Q8NF37 534 aa21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 MDGA1Q8NFP4 955 aa21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 CATSPER2Q96P56 530 aa21.74■■□□□ 1.07
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SPHK1-201ENST00000323374 ADGRE3Q9BY15 652 aa21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 H0Y626 953 aa21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 PDHA1P08559 390 aa21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 EPHB1P54762 984 aa21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 AP2B1P63010 937 aa21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM198Q66K66 360 aa21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 CEP70Q8NHQ1 597 aa21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 TBX21Q9UL17 535 aa21.74■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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SPHK1-201ENST00000323374 TMCC1O94876 653 aa21.73■■□□□ 1.07
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SPHK1-201ENST00000323374 KIRREL3Q8IZU9 778 aa21.73■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.73■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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SPHK1-201ENST00000323374 GSTO2Q9H4Y5 243 aa21.73■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 ZBTB26Q9HCK0 441 aa21.73■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 SPG21Q9NZD8 308 aa21.73■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 FIS1Q9Y3D6 152 aa21.73■■□□□ 1.07
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SPHK1-201ENST00000323374 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SPHK1-201ENST00000323374 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
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SPHK1-201ENST00000323374 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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SPHK1-201ENST00000323374 CCDC68Q9H2F9 335 aa21.72■■□□□ 1.07
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