RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 TRPC4APQ8TEL6 797 aa20.24■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 SNX13Q9Y5W8 968 aa20.24■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 DLX3O60479 287 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 EFEMP2O95967 443 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 ATF6P18850 670 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 PSMD8P48556 350 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 HCAR3P49019 387 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 CSRP3P50461 194 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 EFEMP1Q12805 493 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 BIRC8Q96P09 236 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 APOL2Q9BQE5 337 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 PCDHAC1Q9H158 963 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 XPR1Q9UBH6 696 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 HEATR9A2RTY3 570 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 E7ENX8 843 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 SDHDO14521 159 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 TIMP1P01033 207 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 NELFEP18615 380 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 TUBA4AP68366 448 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 STX5Q13190 355 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 MAPRE2Q15555 327 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 PSMD5Q16401 504 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 KCTD11Q693B1 232 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 POTEHQ6S545 545 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 MIB1Q86YT6 1006 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 KDM1BQ8NB78 822 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 IL37Q9NZH6 218 aa20.23■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 TMEM233B4DJY2 109 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 COL6A2P12110 1019 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 TPH1P17752 444 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 PGGT1BP53609 377 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 MTX3Q5HYI7 312 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 MYO1HQ8N1T3 1032 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 EFHD1Q9BUP0 239 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 GBA3Q9H227 469 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 NEU3Q9UQ49 428 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 COL4A6Q14031 1691 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 NMBRP28336 390 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 KLHL35Q6PF15 583 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 HM13Q8TCT9 377 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 OSBPL2Q9H1P3 480 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 MTRRQ9UBK8 725 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 ACOT9Q9Y305 439 aa20.22■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 FAM92AA1XBS5 289 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 NPHS1O60500 1241 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 C14orf80Q86SX3 495 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 CROCCP3Q8IVE0 287 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 RIN3Q8TB24 985 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 LPGAT1Q92604 370 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 MRGBPQ9NV56 204 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 TARM1B6A8C7 271 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 DNAJB1P25685 340 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 SLC7A1P30825 629 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 ARTNQ5T4W7 220 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 ZNF554Q86TJ5 538 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 FNDC8Q8TC99 324 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 SERPINB11Q96P15 392 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 CIB1Q99828 191 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 TRPC7Q9HCX4 862 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 OLAHQ9NV23 265 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 MPP6Q9NZW5 540 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.21■□□□□ 0.83
VGF-201ENST00000249330 CCDC78A2IDD5 438 aa20.2■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 HMBSP08397 361 aa20.2■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 NDST2P52849 883 aa20.2■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 PELI3Q8N2H9 469 aa20.2■□□□□ 0.82
VGF-201ENST00000249330 HSPBAP1Q96EW2 488 aa20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116 ms