RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gjc1P28229 396 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TigitP86176 249 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdh6P97326 790 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Faf2Q3TDN2 445 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 9130409I23RikQ3TS87 320 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Uap1l1Q3TW96 507 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Elf3Q3UPW2 391 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hspb6Q5EBG6 162 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fut10Q5F2L2 481 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tsr1Q5SWD9 803 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Irf4Q64287 450 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bcl2l1Q64373 233 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zswim9Q6DI92 447 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhl5Q6PFE1 708 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Defb14Q7TNV9 67 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr366Q7TRY4 309 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acat3Q80X81 397 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ap5m1Q8BJ63 490 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sfr1Q8BP27 319 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B4gat1Q8BWP8 415 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc87Q8CDL9 855 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Snx30Q8CE50 437 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spata4Q8K3V1 295 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dusp19Q8K4T5 220 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prdm9Q96EQ9 843 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spz1Q99MY0 378 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vsig1Q9D2J4 407 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RangrfQ9JIB0 185 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Egfl6Q9JJZ5 550 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hapln1Q9QUP5 356 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mta2Q9R190 668 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyb561d2Q9WUE3 222 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PoleQ9WVF7 2283 aa11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ssxb9A2BI93 185 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PurbO35295 324 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Socs5O54928 536 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CraddO88843 199 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LgmnO89017 435 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mtnd3P03899 115 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PpiaP17742 164 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 F3P20352 294 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TrhrP21761 393 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cct8P42932 548 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psen1P49769 467 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Emilin3P59900 758 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tbx4P70325 552 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf367Q0VDT2 340 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trim38Q5SZ99 471 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lcp1Q61233 627 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kcnc3Q63959 769 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kyat3Q71RI9 455 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr309Q7TS01 308 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fnip2Q80TD3 1108 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adamts4Q8BNJ2 833 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Suds3Q8BR65 328 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clasp2Q8BRT1 1286 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3411Q8C7R2 150 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc22a6Q8VC69 545 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zdhhc12Q8VC90 267 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpn2Q8VEJ1 310 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cela1Q91X79 266 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GpnmbQ99P91 574 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Creld2Q9CYA0 350 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam83dQ9D7I8 585 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aldh7a1Q9DBF1 539 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Capn12Q9ER56 720 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klra17Q9JMA4 273 aa11.19□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ShdO88834 343 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ptpn1P35821 432 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pth1rP41593 591 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcbp4P57724 403 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ypel5P62700 121 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr143P70259 405 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SpertQ32MG2 446 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdkl4Q3TZA2 342 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Apcdd1Q3U128 514 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr165Q3V3A3 455 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EgflamQ4VBE4 1017 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Proser1Q5PRE5 913 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cep70Q6IQY5 616 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Maml1Q6T264 1020 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnajc15Q78YY6 149 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fstl5Q8BFR2 847 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slu7Q8BHJ9 585 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4933402J07RikQ8BHX0 270 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nlrp4aQ8BU40 982 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Apol7cQ8C6E1 369 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acat2Q8CAY6 397 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cep57Q8CEE0 500 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il17cQ8K4C5 194 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ecrg4Q99LS0 148 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dcp2Q9CYC6 422 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cfap57Q9D180 1249 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Duoxa2Q9D311 320 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HaghlQ9DB32 283 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr706Q9EPF8 316 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hmgn5Q9JL35 406 aa11.18□□□□□ -0.62
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Asb4Q9WV71 426 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.8 ms