RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 SRCP12931 536 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 EPB42P16452 691 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 MX2P20592 715 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 GKP32189 559 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SSR1P43307 286 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 HCAR3P49019 387 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 IDH3AP50213 366 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 AIF1P55008 147 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 CLDN6P56747 220 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SEMG2Q02383 582 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 TNP2Q05952 138 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 KIF5AQ12840 1032 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 OVGP1Q12889 678 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 BOLA3Q53S33 107 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 HES3Q5TGS1 186 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 LRRC38Q5VT99 294 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 AGBL4Q5VU57 503 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 RETSATQ6NUM9 610 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 C22orf39Q6P5X5 142 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 FBXL19Q6PCT2 694 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 IQCHQ86VS3 1027 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 TRIM69Q86WT6 500 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 TREML1Q86YW5 311 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 DCAF4L2Q8NA75 395 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 CHST14Q8NCH0 376 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SAP25Q8TEE9 199 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 NXPE2Q96DL1 559 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 OLFM3Q96PB7 478 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 RNF157Q96PX1 679 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 GORASP1Q9BQQ3 440 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ORAI3Q9BRQ5 295 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF670Q9BS34 389 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PREBQ9HCU5 417 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ATP13A1Q9HD20 1204 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 FZD3Q9NPG1 666 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 BRD7Q9NPI1 651 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM51Q9NW97 253 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 DTLQ9NZJ0 730 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 IL36AQ9UHA7 158 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PPM1HQ9ULR3 514 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 HPCAL4Q9UM19 191 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 HS3ST2Q9Y278 367 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 CA5BQ9Y2D0 317 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ADAMTS20P59510 1910 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 EPG5Q9HCE0 2579 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 CHD8Q9HCK8 2581 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 H3BRJ5 948 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 INSIG1O15503 277 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 LATO43561 262 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SPOPO43791 374 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 MAFKO60675 156 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PRAMEF11O60813 436 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 LEFTY1O75610 366 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PTMAP06454 111 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 C1SP09871 688 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ALPPL2P10696 532 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 CKMT2P17540 419 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 DESP17661 470 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PTPN7P35236 360 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ETFBP38117 255 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SLC1A1P43005 524 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ABCG1P45844 678 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 RXRGP48443 463 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SERPINB4P48594 390 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 MAPKAPK2P49137 400 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ARSDP51689 593 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 NEK3P51956 506 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 CLDN2P57739 230 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 DYNLT1P63172 113 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SLC10A7Q0GE19 358 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 GALNT2Q10471 571 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ZBTB17Q13105 803 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.461e-9■■■■■ 30
LINC00963-215ENST00000622972 SGCGQ13326 291 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SERINC3Q13530 473 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 CYTH1Q15438 398 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SHBQ15464 509 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ALKBH2Q6NS38 261 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 MICALCLQ6ZW33 695 aa5.93□□□□□ -1.46
LINC00963-215ENST00000622972 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms