RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 NIPA2Q8N8Q9 360 aa22.15■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.15■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 SEPT3Q9UH03 358 aa22.15■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa22.14■■□□□ 1.14
SRRT-218ENST00000620394 PEX11BO96011 259 aa22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ANXA6P08133 673 aa22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 HK3P52790 923 aa22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 C1orf61Q13536 156 aa22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ALG11Q2TAA5 492 aa22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 BOLA3Q53S33 107 aa22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 FAXCQ5TGI0 409 aa22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 DPPA4Q7L190 304 aa22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 TEKT4Q8WW24 435 aa22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 NSMCE3Q96MG7 304 aa22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 CCDC3Q9BQI4 270 aa22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 APOOQ9BUR5 198 aa22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 CBX8Q9HC52 389 aa22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa22.14■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 PLD2O14939 933 aa22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 YY2O15391 372 aa22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 PRKCGP05129 697 aa22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 KRT10P13645 584 aa22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 CR2P20023 1033 aa22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 HTR1BP28222 390 aa22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ARL4AP40617 200 aa22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 RENBPP51606 427 aa22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 FANCCQ00597 558 aa22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 BCL2L1Q07817 233 aa22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 INPP5AQ14642 412 aa22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 LBRQ14739 615 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 LVRNQ6Q4G3 990 aa22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 IQCDQ96DY2 449 aa22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 IL17BQ9UHF5 180 aa22.13■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 SCN8AQ9UQD0 1980 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 RASGRP1O95267 797 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ITGB2P05107 769 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ALPIP09923 528 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 GM2AP17900 193 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 KIAA1024LP59773 190 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ELOCQ15369 112 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 LIPIQ6XZB0 460 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 LUZP1Q86V48 1076 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 EXD3Q8N9H8 876 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ATL2Q8NHH9 583 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 WDR92Q96MX6 357 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 TRIM4Q9C037 500 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ACSL6Q9UKU0 697 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 OR1A2Q9Y585 309 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 DGKBQ9Y6T7 804 aa22.12■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 PTPN13Q12923 2485 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 SYCE3A1L190 88 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 TERTO14746 1132 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 SOCS5O75159 536 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 PCCBP05166 539 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ELFN1P0C7U0 828 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 RARAP10276 462 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 SCNN1BP51168 640 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ZBED6P86452 979 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 HID1Q8IV36 788 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ARL10Q8N8L6 244 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 PLA2G15Q8NCC3 412 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 SGF29Q96ES7 293 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 MGME1Q9BQP7 344 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 THAP2Q9H0W7 228 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 WDR70Q9NW82 654 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 KLQ9UEF7 1012 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 PADI4Q9UM07 663 aa22.11■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 D6RAR5 112 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 MAFKO60675 156 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 SERPING1P05155 500 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 CYP1A2P05177 515 aa22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SRRT-218ENST00000620394 AMPD1P23109 780 aa22.1■■□□□ 1.13
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