RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 JMJD7P0C870 316 aa25.01■■□□□ 1.59
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PTPRF-216ENST00000617451 C14orf28Q4W4Y0 310 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRF-216ENST00000617451 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa25.01■■□□□ 1.59
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PTPRF-216ENST00000617451 NSMCE3Q96MG7 304 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRF-216ENST00000617451 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
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PTPRF-216ENST00000617451 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 ATP1A3P13637 1013 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRF-216ENST00000617451 KRT10P13645 584 aa24.95■■□□□ 1.58
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