RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614494.1

TARDBP-216, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene TARDBP, Length 515 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-216ENST00000614494 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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TARDBP-216ENST00000614494 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.27□□□□□ -1.25
TARDBP-216ENST00000614494 EFHD1Q9BUP0 239 aa7.27□□□□□ -1.25
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TARDBP-216ENST00000614494 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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TARDBP-216ENST00000614494 PERM1Q5SV97 790 aa7.26□□□□□ -1.25
TARDBP-216ENST00000614494 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa7.26□□□□□ -1.25
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TARDBP-216ENST00000614494 TAF8Q7Z7C8 310 aa7.26□□□□□ -1.25
TARDBP-216ENST00000614494 PIM3Q86V86 326 aa7.26□□□□□ -1.25
TARDBP-216ENST00000614494 NLRP8Q86W28 1048 aa7.26□□□□□ -1.25
TARDBP-216ENST00000614494 JAMLQ86YT9 394 aa7.26□□□□□ -1.25
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TARDBP-216ENST00000614494 NUS1Q96E22 293 aa7.26□□□□□ -1.25
TARDBP-216ENST00000614494 SGF29Q96ES7 293 aa7.26□□□□□ -1.25
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TARDBP-216ENST00000614494 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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TARDBP-216ENST00000614494 IVLP07476 585 aa7.25□□□□□ -1.25
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TARDBP-216ENST00000614494 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
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TARDBP-216ENST00000614494 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.25□□□□□ -1.25
TARDBP-216ENST00000614494 MANEAQ5SRI9 462 aa7.25□□□□□ -1.25
TARDBP-216ENST00000614494 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7.25□□□□□ -1.25
TARDBP-216ENST00000614494 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa7.25□□□□□ -1.25
TARDBP-216ENST00000614494 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TARDBP-216ENST00000614494 PNCKQ6P2M8 343 aa7.25□□□□□ -1.25
TARDBP-216ENST00000614494 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.25□□□□□ -1.25
TARDBP-216ENST00000614494 LIPIQ6XZB0 460 aa7.25□□□□□ -1.25
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