RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	DNAJA2	O60884	412 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	RAMP2	O60895	175 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SPON2	Q9BUD6	331 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	ASB3	Q9Y575	518 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SEPT4	O43236	478 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	MMP2	P08253	660 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	FGFR3	P22607	806 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PRKAA2	P54646	552 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	IRF5	Q13568	498 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PDK3	Q15120	406 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CALML6	Q8TD86	181 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CNBD2	Q96M20	576 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PDP2	Q9P2J9	529 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	MUSK	O15146	869 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SUPT3H	O75486	399 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	GATM	P50440	423 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	GK3P	Q14409	553 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	LILRA2	Q8N149	483 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	FAM50B	Q9Y247	325 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341		A0A0D9SEW6	157 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341		A0A0U1RQS6	177 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341		E7ENX8	843 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	NPHS1	O60500	1241 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PFDN1	O60925	122 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	ADAMTS4	O75173	837 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	E2F6	O75461	281 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	RHOQ	P17081	205 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PML	P29590	882 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	KCNQ1	P51787	676 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF235	Q14590	738 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	TLR1	Q15399	786 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	NRF1	Q16656	503 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PAOX	Q6QHF9	649 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PTER	Q96BW5	349 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PKP2	Q99959	881 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	APPL1	Q9UKG1	709 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		12.93	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	TYMP	P19971	482 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CLCN5	P51795	746 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PSME3	P61289	254 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CBX3	Q13185	183 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PFKFB4	Q16877	469 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	KIF19	Q2TAC6	998 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	AFMID	Q63HM1	303 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SLC39A13	Q96H72	371 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	S1PR4	O95977	384 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PFKP	Q01813	784 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	IYD	Q6PHW0	289 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SCML4	Q8N228	414 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	C3orf30	Q96M34	536 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	KCNA7	Q96RP8	456 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	SCML2	Q9UQR0	700 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		12.92	□□□□□ -0.34
SMTN-222	ENST00000612341	UBXN8	O00124	270 aa		12.91	□□□□□ -0.34

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