RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 RABGEF1Q9UJ41 708 aa23.95■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 RIMKLBQ9ULI2 386 aa23.95■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 UPK3BL1B0FP48 263 aa23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 UPK3BL2E5RIL1 263 aa23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 SLC4A1P02730 911 aa23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 LPOP22079 712 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 PSMD8P48556 350 aa23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 LRRC32Q14392 662 aa23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 LONRF1Q17RB8 773 aa23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 EOGTQ5NDL2 527 aa23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 MDGA1Q8NFP4 955 aa23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 STYXQ8WUJ0 223 aa23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 ERLEC1Q96DZ1 483 aa23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 ALDH1A2O94788 518 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 CNGA3Q16281 694 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 TTC7BQ86TV6 843 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 OR2T3Q8NH03 318 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 CDKL2Q92772 493 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 LYSMD1Q96S90 227 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 TREX1Q9NSU2 369 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 MOCS1Q9NZB8 636 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 NFS1Q9Y697 457 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 ADAM23O75077 832 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 TIMP2P16035 220 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 PDPK2PQ6A1A2 396 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 ERAP2Q6P179 960 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF449Q6P9G9 518 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 CROCCP2Q86T23 111 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 CERS2Q96G23 380 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 KCTD3Q9Y597 815 aa23.93■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 AURKAO14965 403 aa23.92■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 STX7O15400 261 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 ADH1BP00325 375 aa23.92■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 SUOXP51687 545 aa23.92■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 MGAT5Q09328 741 aa23.92■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 PTPRRQ15256 657 aa23.92■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa23.92■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 CEP85LQ5SZL2 805 aa23.92■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 FBXL19Q6PCT2 694 aa23.92■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa23.92■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 TTC30BQ8N4P2 665 aa23.92■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 LRFN3Q9BTN0 628 aa23.92■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 PPCSQ9HAB8 311 aa23.92■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 PKP3Q9Y446 797 aa23.92■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 WDFY4Q6ZS81 3184 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 KRBA1A5PL33 1030 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 GOLGA6L10A6NI86 522 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 BUD23O43709 281 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 STARD6P59095 220 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 PRAMEP78395 509 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 SATB1Q01826 763 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF844Q08AG5 666 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 UBXN2BQ14CS0 331 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 CST6Q15828 149 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM31Q5JXX7 168 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 KCNMB4Q86W47 210 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 RASSF3Q86WH2 238 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 CTAGE3PQ8IX95 158 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 SIX5Q8N196 739 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 SYNPOQ8N3V7 929 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 ARRDC3Q96B67 414 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 NELL2Q99435 816 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 PCDH12Q9NPG4 1184 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 B4GALT6Q9UBX8 382 aa23.91■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 FAM159BA6NKW6 160 aa23.9■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa23.9■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 RASGRF2O14827 1237 aa23.9■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 VAPBO95292 243 aa23.9■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 VIPR1P32241 457 aa23.9■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGEF7Q14155 803 aa23.9■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 KRT71Q3SY84 523 aa23.9■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 LRRC73Q5JTD7 316 aa23.9■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 KIAA1211LQ6NV74 962 aa23.9■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 CRTC1Q6UUV9 634 aa23.9■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa23.9■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 OR4K2Q8NGD2 314 aa23.9■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 OR13J1Q8NGT2 312 aa23.9■■□□□ 1.42
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM109Q9BVC6 243 aa23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms