RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516259.1

RNU6-390P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 390, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-390P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-390P-201ENST00000516259 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM71Q6P5X7 295 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PARM1Q6UWI2 310 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANKRD23Q86SG2 305 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PIP4P1Q86T03 277 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 HORMAD2Q8N7B1 307 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 LRRC57Q8N9N7 239 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC16A11Q8NCK7 471 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 C16orf52Q8NHV5 167 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 HUS1BQ8NHY5 278 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CEP76Q8TAP6 659 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM174Q8WUU8 243 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 EME1Q96AY2 570 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC22A18Q96BI1 424 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 VCPIP1Q96JH7 1222 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PDE7BQ9NP56 450 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PDGFCQ9NRA1 345 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 DECR2Q9NUI1 292 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 FBXW11Q9UKB1 542 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PCDHGB4Q9UN71 923 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ERVK-11Q9UQG0 969 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 BTBD3Q9Y2F9 522 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CMAHPQ9Y471 501 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 STON1Q9Y6Q2 735 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF541Q9H0D2 1346 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 KAT6AQ92794 2004 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 H7C0S8 307 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MASP2O00187 686 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC25A17O43808 307 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLPIP03973 132 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 DNTTP04053 509 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TPOP07202 933 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MAOAP21397 527 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GCH1P30793 250 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 KRT20P35900 424 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SNX16P57768 344 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ITGADQ13349 1161 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 NEDD9Q14511 834 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PSMD6Q15008 389 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 EPHA10Q5JZY3 1008 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 QSOX2Q6ZRP7 698 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MTSS1LQ765P7 747 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 DNAAF5Q86Y56 855 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GPSM1Q86YR5 675 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC35F3Q8IY50 421 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SCML4Q8N228 414 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMTC2Q8N394 836 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZBTB2Q8N680 514 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 POMGNT2Q8NAT1 580 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 MXD3Q9BW11 206 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CYSLTR2Q9NS75 346 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ACSL5Q9ULC5 683 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF804BA4D1E1 1349 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CGB1A6NKQ9 187 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 A6NNC1 897 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 UBE2CO00762 179 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 GJB3O75712 270 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 EPN2O95208 641 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 FSHBP01225 129 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 FGBP02675 491 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 FGF2P09038 288 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CLTBP09497 229 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 TFPIP10646 304 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARSBP15848 533 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 EDN2P20800 178 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 FBLP22087 321 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-390P-201ENST00000516259 CD38P28907 300 aa3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms