RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, human

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCAMP4-208	ENST00000489554	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	ASB12	Q8WXK4	309 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	MAML1	Q92585	1016 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	KLK6	Q92876	244 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	KRT12	Q99456	494 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	MYOC	Q99972	504 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	DKK3	Q9UBP4	350 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	LHX3	Q9UBR4	397 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	AMACR	Q9UHK6	382 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	KLK13	Q9UKR3	277 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	KNL1	Q8NG31	2342 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554		A6NNZ2	444 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554		H7C0C1	242 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	ETS1	P14921	441 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	MX2	P20592	715 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCNC	P24863	283 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	IVD	P26440	423 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	ATP5O	P48047	213 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	CSNK1D	P48730	415 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	CYTH1	Q15438	398 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	TTC7B	Q86TV6	843 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	CNTD1	Q8N815	330 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	OR13H1	Q8NG92	308 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	ATL2	Q8NHH9	583 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	GATA6	Q92908	595 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	VOPP1	Q96AW1	172 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	IFT43	Q96FT9	208 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	IL12RB2	Q99665	862 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	SP110	Q9HB58	689 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	FZD3	Q9NPG1	666 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	TSPAN11	A1L157	253 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCDC151	A5D8V7	595 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	IGLON5	A6NGN9	336 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	KCNK1	O00180	336 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	FPGT	O14772	594 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	AREL1	O15033	823 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	MUSK	O15146	869 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	MATN3	O15232	486 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	TP73	O15350	636 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	TTI1	O43156	1089 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	SPINT1	O43278	529 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	C1QTNF9	P0C862	333 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	CDK4	P11802	303 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	PTPN3	P26045	913 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	RABIF	P47224	123 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	CLDN2	P57739	230 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	IL10RB	Q08334	325 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	ELP6	Q0PNE2	266 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	BNIP3	Q12983	259 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	FGL2	Q14314	439 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	IHH	Q14623	411 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	CFAP58	Q5T655	872 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554		Q6ZSR6	202 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	JAML	Q86YT9	394 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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