RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475527.1

PTPRG-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRG, Length 2,694 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-205ENST00000475527 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 C1orf50Q9BV19 199 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 CMTM6Q9NX76 183 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRG-205ENST00000475527 HTR3EA5X5Y0 456 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 ANGPT2O15123 496 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 POLD2P49005 469 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 CCDC126Q96EE4 140 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 C19orf60Q96EN9 201 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 MAF1Q9H063 256 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 TMEM9Q9P0T7 183 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 V9GYQ6 96 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 TRIM64BA6NI03 449 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 ELK4P28324 431 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 AGAP9Q5VTM2 703 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 LCN8Q6JVE9 175 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 OLFM1Q99784 485 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 AKTIPQ9H8T0 292 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 PALMDQ9NP74 551 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 FBXO5Q9UKT4 447 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 AP3B1O00203 1094 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 CAPN3P20807 821 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 SLC26A2P50443 739 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 HLCSP50747 726 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 POU4F1Q01851 419 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 SEPT6Q14141 434 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 SULF1Q8IWU6 871 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 BEST2Q8NFU1 509 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 OR13F1Q8NGS4 319 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 GSTO2Q9H4Y5 243 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 ABCD2Q9UBJ2 740 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 GINS2Q9Y248 185 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 RAD54BQ9Y620 910 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa20.2■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 GFAPP14136 432 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 NCK1P16333 377 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 BNIP2Q12982 314 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 TRIM16LQ309B1 348 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 TMEM53Q6P2H8 277 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 VAT1Q99536 393 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 FICDQ9BVA6 458 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 NDUFAF1Q9Y375 327 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 BBIP1A8MTZ0 92 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 HSD17B1P14061 328 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 MLLT10P55197 1068 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 BFSP2Q13515 415 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 PRMT9Q6P2P2 845 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 LBX2Q6XYB7 198 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 BNIPLQ7Z465 357 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 IGFN1Q86VF2 1251 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 SNX27Q96L92 541 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 TUBA1CQ9BQE3 449 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 DSEQ9UL01 958 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 SPTLC1O15269 473 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 NCAM1P13591 858 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 TMBIM6P55061 237 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 CDH13P55290 713 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 GEN1Q17RS7 908 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 CORO1BQ9BR76 489 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 NANOGQ9H9S0 305 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 RIC8BQ9NVN3 520 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 GJD2Q9UKL4 321 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 IQCA1LA6NCM1 817 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 CLPXO76031 633 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 C7P10643 843 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 SLC6A2P23975 617 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 ATP4BP51164 291 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 SEMA3BQ13214 749 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRG-205ENST00000475527 SNX19Q92543 992 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms