RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463006.5

CNOT10-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, human

TSL 3

Gene CNOT10, Length 692 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT10-208	ENST00000463006	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006		H7C1Q1	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PPP6C	O00743	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	EXOC3	O60645	756 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CNTN5	O94779	1100 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CBX6	O95503	412 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SERPINC1	P01008	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TPO	P07202	933 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	NPS	P0C0P6	89 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CYP2D6	P10635	497 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ERCC2	P18074	760 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	NPY4R	P50391	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	GALC	P54803	685 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ADPRH	P54922	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	GRAP	Q13588	217 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	IL11RA	Q14626	422 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	RPE65	Q16518	533 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MPP7	Q5T2T1	576 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	EXOC4	Q96A65	974 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	RITA1	Q96K30	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PSMD14	O00487	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	USP12	O75317	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC22A3	O75751	556 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC2A4	P14672	509 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ITGB6	P18564	788 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TGM2	P21980	687 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	HOXC8	P31273	242 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CCR10	P46092	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PSG6	Q00889	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TFAP4	Q01664	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	LMAN2	Q12907	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	COASY	Q13057	564 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	GAB1	Q13480	694 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PTK6	Q13882	451 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TNIP1	Q15025	636 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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