RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435142.1

USP9YP28-201, Transcript of USP9Y pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP28, Length 589 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP28-201ENST00000435142 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.5□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 AMDHD2Q9Y303 409 aa3.5□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa3.5□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A087X002 238 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 E9PQ18 207 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 WDR1O75083 606 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 ITGA2BP08514 1039 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 MYL3P08590 195 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 RYKP34925 604 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 PNPLA4P41247 253 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 AP2B1P63010 937 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 TNFAIP2Q03169 654 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 GAGE5Q13069 117 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 GAGE6Q13070 117 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 CTF1Q16619 201 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 RGMBQ6NW40 437 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 RASGRP2Q7LDG7 609 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF34Q8IZ26 560 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 SCRN2Q96FV2 425 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 CNGB3Q9NQW8 809 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 RASAL2Q9UJF2 1139 aa3.49□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 KRTAP5-8O75690 187 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 EGFP01133 1207 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 CD48P09326 243 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 MYOD1P15172 320 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 CD58P19256 250 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 ITGAXP20702 1163 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 CD72P21854 359 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 CLCNKAP51800 687 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 RUNX1T1Q06455 604 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 PTK2BQ14289 1009 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 SH2D4BQ5SQS7 431 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF790Q6PG37 636 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 SYTL1Q8IYJ3 562 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 PPM1EQ8WY54 764 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 EID2BQ96D98 161 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 MOCOSQ96EN8 888 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 SYT17Q9BSW7 474 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 FGF22Q9HCT0 170 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 CHST12Q9NRB3 414 aa3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A0G2JLW4 131 aa3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 APAF1O14727 1248 aa3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 DCXO43602 365 aa3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 CHATP28329 748 aa3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 HOXC8P31273 242 aa3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 TM4SF4P48230 202 aa3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 EFNA5P52803 228 aa3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 GTF2H2Q13888 395 aa3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 ASB18Q6ZVZ8 466 aa3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 GDPD5Q8WTR4 605 aa3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 SNAPC3Q92966 411 aa3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 OR2W1Q9Y3N9 320 aa3.47□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa3.46□□□□□ -1.85
USP9YP28-201ENST00000435142 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 KLRF2D3W0D1 207 aa3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 SEPT4O43236 478 aa3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 CIDEAO60543 219 aa3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 RUNX2Q13950 521 aa3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 FBXL16Q8N461 479 aa3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 GJC3Q8NFK1 279 aa3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 HSPH1Q92598 858 aa3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 KLHL29Q96CT2 875 aa3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 TRIM51Q9BSJ1 452 aa3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 HAUS8Q9BT25 410 aa3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 SARGQ9BW04 601 aa3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 CACNG5Q9UF02 275 aa3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 SMCHD1A6NHR9 2005 aa3.46□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 CROCCQ5TZA2 2017 aa3.45□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A0U1RQF3 1178 aa3.45□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 IGHV4-39P01824 125 aa3.45□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 CSF1P09603 554 aa3.45□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 ISL1P61371 349 aa3.45□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 PDE1BQ01064 536 aa3.45□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 IL20RBQ6UXL0 311 aa3.45□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC36A4Q6YBV0 504 aa3.45□□□□□ -1.86
USP9YP28-201ENST00000435142 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms