RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGEA8P43361 318 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 APLP1P51693 650 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ADRM1Q16186 407 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ANO4Q32M45 955 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDT8Q8WV74 236 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRHDEQ9UKU6 1024 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GRXCR2A6NFK2 248 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 VNN2O95498 520 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-DQB2P05538 268 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM58BPP0C7Q3 252 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NCAM1P13591 858 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HADHAP40939 763 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 POLD2P49005 469 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFAIP2Q03169 654 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PPIL2Q13356 520 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PMS2P3Q13401 168 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CILP2Q8IUL8 1156 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA6LQ8N4H0 392 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRPV3Q8NET8 790 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZUFSPQ96AP4 578 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPBAP1Q96EW2 488 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ELMO2Q96JJ3 720 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LRGUKQ96M69 825 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ULBP1Q9BZM6 244 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BLOC1S6Q9UL45 172 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PLXNA3P51805 1871 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 COL4A6Q14031 1691 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC78A2IDD5 438 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AIM2O14862 343 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC7A4O43246 635 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SULT1C4O75897 302 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IPO13O94829 963 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT19P08727 400 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CD1DP15813 335 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CA5AP35218 305 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IDUAP35475 653 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NPY2RP49146 381 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC7A2P52569 658 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GRB7Q14451 532 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CRY1Q16526 586 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBED5Q49AG3 693 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PITRM1Q5JRX3 1037 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAF7Q6Q0C0 670 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB132Q7Z7B7 95 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CUZD1Q86UP6 607 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CBR4Q8N4T8 237 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPAN14Q8NG11 270 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52E4Q8NGH9 312 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPEARQ8WU66 669 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A17Q8WUG5 538 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRMOQ9BU70 441 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ADI1Q9BV57 179 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM8Q9BZR9 551 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM4Q9C037 500 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NMUR1Q9HB89 426 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OR12D3Q9UGF7 316 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AP4S1Q9Y587 144 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KCTD3Q9Y597 815 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGEB16A2A368 324 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDN5O00501 218 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MPOP05164 745 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MYL3P08590 195 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BDNFP23560 247 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB10P61026 200 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TYSND1Q2T9J0 566 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RABL3Q5HYI8 236 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD34AQ69YU3 496 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DCDC5Q6ZRR9 648 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1958Q8N8K9 716 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PCED1BQ96HM7 432 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPN18Q99952 460 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PDFQ9HBH1 243 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PIM2Q9P1W9 311 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RIMKLBQ9ULI2 386 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 F11P03951 625 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ALPLP05186 524 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF286BP0CG31 522 aa3.64□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CPB1P15086 417 aa3.64□□□□□ -1.83
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