RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343217.6

DUSP28-201, Transcript of dual specificity phosphatase 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene DUSP28, Length 1,555 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28-201ENST00000343217 PAMP19021 973 aa20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 MGAT5Q09328 741 aa20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 LGSNQ5TDP6 509 aa20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 PRR23BQ6ZRT6 265 aa20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 PPM1NQ8N819 430 aa20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 MFSD3Q96ES6 412 aa20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 TM6SF2Q9BZW4 377 aa20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 SENP1Q9P0U3 644 aa20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 DEC1Q9P2X7 70 aa20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 TBK1Q9UHD2 729 aa20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.94■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 OPRD1P41143 372 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 LPAL2Q16609 132 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 SKIDA1Q1XH10 827 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 PLPP6Q8IY26 295 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 PARD6AQ9NPB6 346 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 DLL3Q9NYJ7 618 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 CHKBQ9Y259 395 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 SOCS5O75159 536 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 RETP07949 1114 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 NR1D1P20393 614 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 RAD51Q06609 339 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 GRM3Q14832 879 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 TMED2Q15363 201 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 GEN1Q17RS7 908 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 EMC10Q5UCC4 262 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 CES3Q6UWW8 571 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 ZFATQ9P243 1243 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 RIMKLBQ9ULI2 386 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.93■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 SDK1Q7Z5N4 2213 aa20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 TIMM44O43615 452 aa20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 NMBRP28336 390 aa20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 SERPINB9P50453 376 aa20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 BCL2L1Q07817 233 aa20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 TRAF2Q12933 501 aa20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 SEPT6Q14141 434 aa20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 GALNT3Q14435 633 aa20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 ACCSLQ4AC99 568 aa20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 TMEM215Q68D42 235 aa20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 CAMKK1Q8N5S9 505 aa20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 SMYD2Q9NRG4 433 aa20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 TREX1Q9NSU2 369 aa20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 MYLKQ15746 1914 aa20.92■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 FZD6O60353 706 aa20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 LRP3O75074 770 aa20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 KRT37O76014 449 aa20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 PRLP01236 227 aa20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 KRT15P19012 456 aa20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 CNTFP26441 200 aa20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 DLG2Q15700 870 aa20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 ARMC12Q5T9G4 340 aa20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 SYT13Q7L8C5 426 aa20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 KCNMB4Q86W47 210 aa20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 C12orf40Q86WS4 652 aa20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 CYP4X1Q8N118 509 aa20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
DUSP28-201ENST00000343217 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms