RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315965.6

CCDC71L-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71 like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC71L, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71L-201ENST00000315965 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CCDC71L-201ENST00000315965 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa24.08■■□□□ 1.45
CCDC71L-201ENST00000315965 AURKAO14965 403 aa24.08■■□□□ 1.45
CCDC71L-201ENST00000315965 C5AR1P21730 350 aa24.08■■□□□ 1.45
CCDC71L-201ENST00000315965 LPOP22079 712 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CCDC71L-201ENST00000315965 METAP1P53582 386 aa24.08■■□□□ 1.45
CCDC71L-201ENST00000315965 RPS14P62263 151 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CCDC71L-201ENST00000315965 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CCDC71L-201ENST00000315965 SKIDA1Q1XH10 827 aa24.08■■□□□ 1.45
CCDC71L-201ENST00000315965 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CCDC71L-201ENST00000315965 TTC30BQ8N4P2 665 aa24.08■■□□□ 1.45
CCDC71L-201ENST00000315965 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CCDC71L-201ENST00000315965 HDAC8Q9BY41 377 aa24.08■■□□□ 1.45
CCDC71L-201ENST00000315965 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa24.08■■□□□ 1.45
CCDC71L-201ENST00000315965 CD248Q9HCU0 757 aa24.08■■□□□ 1.45
CCDC71L-201ENST00000315965 PCDH12Q9NPG4 1184 aa24.08■■□□□ 1.45
CCDC71L-201ENST00000315965 TRIOO75962 3097 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 ATG13O75143 517 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 NEK3P51956 506 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 FAM193AP78312 1265 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 ZXDAP98168 799 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 LRRC73Q5JTD7 316 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 CYS1Q717R9 158 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 IQCKQ8N0W5 287 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 FBF1Q8TES7 1133 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 VIPAS39Q9H9C1 493 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF446Q9NWS9 450 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 B4GALT6Q9UBX8 382 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 PLAAQ9Y263 795 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 KCTD3Q9Y597 815 aa24.08■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 MID1O15344 667 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 ALDH1A2O94788 518 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC4A1P02730 911 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 ADRB3P13945 408 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 HMGCLP35914 325 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 CCDC15Q0P6D6 951 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 FZD5Q13467 585 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 CNGA3Q16281 694 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 CRY1Q16526 586 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 CDKN3Q16667 212 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 TJAP1Q5JTD0 557 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 ALS2CLQ60I27 953 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 CRTC1Q6UUV9 634 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 TMPRSS6Q8IU80 811 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 CCDC77Q9BR77 488 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 OSBPL6Q9BZF3 934 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 MOCS1Q9NZB8 636 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa24.07■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 STK25O00506 426 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 STX7O15400 261 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 VIPR1P32241 457 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 ZBTB16Q05516 673 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 ELP6Q0PNE2 266 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 ARHGEF7Q14155 803 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 LONRF1Q17RB8 773 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM92Q6UXU6 159 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 DPPA4Q7L190 304 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 CACUL1Q86Y37 369 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 OR13J1Q8NGT2 312 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 RAB7BQ96AH8 199 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 CERS2Q96G23 380 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 ACSS3Q9H6R3 686 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 RABGEF1Q9UJ41 708 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 SCML1Q9UN30 329 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 PKP3Q9Y446 797 aa24.06■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 A8MX80 341 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 BUD23O43709 281 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 CLDN7O95471 211 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 DNTTP04053 509 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF30P17039 623 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 ACVR1Q04771 509 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 IFFO1Q0D2I5 559 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 CNTN1Q12860 1018 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 STAT4Q14765 748 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 LRRC66Q68CR7 880 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF449Q6P9G9 518 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 SYT13Q7L8C5 426 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 TSPAN33Q86UF1 283 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 OR4K2Q8NGD2 314 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 CYTH2Q99418 400 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 C19orf43Q9BQ61 176 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 MAP2K7O14733 419 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 ATP8B1O43520 1251 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 SHBGP04278 402 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 C7P10643 843 aa24.04■■□□□ 1.44
CCDC71L-201ENST00000315965 LHCGRP22888 699 aa24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms