RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mmp17Q9R0S3 578 aa5.51□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vstm4T1NXB5 319 aa5.51□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sec16aA2AIX1 2377 aa5.51□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Arhgef10Q8C033 1345 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Urb1Q571H0 2274 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cspg4Q8VHY0 2327 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Igkv5-39A0A0G2JDV4 115 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 A0A286YCH8 300 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 3110040M04RikA0A286YDK0 300 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 A0A286YE43 300 aa5.5□□□□□ -1.53
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Stpg3A2RSX4 306 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm13271B1AYH9 182 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Abcb5B5X0E4 1255 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Acp4D3YTS9 425 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm10800D3Z496 220 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm3298E9PW80 205 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Grip2G3XA20 1042 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm3159K7N760 267 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ube3aO08759 870 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Foxd2O35392 492 aa5.5□□□□□ -1.53
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sp1O89090 784 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klrb1cP27814 223 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pla2g2aP31482 146 aa5.5□□□□□ -1.53
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 CpoxP36552 443 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cdc25cP48967 447 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc11a2P49282 568 aa5.5□□□□□ -1.53
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hrh2P97292 397 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mageb5Q14AN0 366 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SpertQ32MG2 446 aa5.5□□□□□ -1.53
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Trappc1-201ENSMUST00000060956 Clca4bQ3UW98 925 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 N4bp2l1Q3V2Q8 238 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr121Q5CZY0 321 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccdc42Q5SV66 316 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lamb3Q61087 1168 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smarcd1Q61466 515 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trim25Q61510 634 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Itih1Q61702 907 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ccpg1Q640L3 753 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ift122Q6NWV3 1182 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hdac4Q6NZM9 1076 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Herc4Q6PAV2 1057 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sdad1Q80UZ2 687 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prima1Q810F0 153 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Csrnp2Q8BGQ2 534 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Snip1Q8BIZ6 383 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 LsampQ8BLK3 341 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Heatr3Q8BQM4 679 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lrrd1Q8C0R9 853 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Q8C1R3 189 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Spata16Q8C636 571 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vwc2Q8C8N3 324 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rab43Q8CG50 210 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmx1Q8VBT0 278 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rpap2Q8VC34 614 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tbc1d19Q8VDV7 526 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mospd1Q8VEL0 213 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr356Q8VFP5 315 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ubl7Q91W67 380 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rrp1bQ91YK2 724 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lactb2Q99KR3 288 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dcp2Q9CYC6 422 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Syce1Q9D495 329 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cmtm2bQ9DAC0 210 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tnfrsf22Q9ER62 198 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sgpp1Q9JI99 430 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sars2Q9JJL8 518 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Egfl6Q9JJZ5 550 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Prl2c5Q9JLV9 222 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc26a4Q9R155 780 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vnn1Q9Z0K8 512 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dpp6Q9Z218 804 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lrit3W8DXL4 681 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Col4a2P08122 1707 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 LrbaQ9ESE1 2856 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MylkQ6PDN3 1941 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Abca12E9Q876 2595 aa5.5□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SonQ9QX47 2444 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm884A2A9H6 3643 aa5.49□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm15821A6X8J8 139 aa5.49□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nhsl2B1AXH1 854 aa5.49□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm13285B1AYI3 182 aa5.49□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm13275B1AYI8 182 aa5.49□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Exoc3l2D3YUP5 789 aa5.49□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Serpina16D3Z660 418 aa5.49□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm20671F6TVX7 576 aa5.49□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DldO08749 509 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ncam2O35136 837 aa5.49□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 ByslO54825 436 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tnnc1P19123 161 aa5.49□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fcer2P20693 331 aa5.49□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Usp4P35123 962 aa5.49□□□□□ -1.53
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rfc1P35601 1131 aa5.49□□□□□ -1.53
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