RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027809.7

Opn3-201, Transcript of Opsin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Opn3, Length 1,913 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3-201ENSMUST00000027809 Serpina3gQ5I2A0 440 aa22.13■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rap1gap2Q5SVL6 712 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Itga7Q61738 1179 aa22.13■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Dclk2Q6PGN3 756 aa22.13■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Wbp1lQ8BGW2 348 aa22.13■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Slc41a1Q8BJA2 512 aa22.13■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Lrch3Q8BVU0 778 aa22.13■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ythdf3Q8BYK6 585 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Dclre1bQ8C7W7 541 aa22.13■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zc2hc1cQ8CCG1 527 aa22.13■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cfap61Q8CEL2 1252 aa22.13■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Pcdha5Q91Y15 934 aa22.13■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tchhl1Q9D3P1 638 aa22.13■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 4930578G10RikQ9D4Q4 153 aa22.13■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Necab3Q9D6J4 353 aa22.13■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Apba1B2RUJ5 842 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ptch2O35595 1182 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 CtsdP18242 410 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gja1P23242 382 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mdga1Q0PMG2 940 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 CcnhQ61458 323 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Creb3Q61817 404 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nfe2l1Q61985 741 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Taf1cQ6PDZ2 836 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Sfr1Q8BP27 319 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fmo9Q8C116 539 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Samd7Q8C8Y5 445 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rtn4rl1Q8K0S5 445 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Olfr1019Q8VGS3 310 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tle6Q9WVB3 581 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Clcn5Q9WVD4 746 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Cyp2a12P56593 492 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ermp1Q3UVK0 898 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Klra8Q60682 266 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ssr4Q62186 172 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Znf668Q8K2R5 619 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nudcd3Q8R1N4 363 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nxnl1Q8VC33 217 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mapk8Q91Y86 384 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Mcoln1Q99J21 580 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ndst3Q9EQH7 873 aa22.12■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ighg3A0A1Y7VJN6 399 aa22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ttll9A2APC3 461 aa22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Olfr742A2RTP5 311 aa22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zfp212G3X8R7 492 aa22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Slc9a3G3X939 829 aa22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 MntO08789 591 aa22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 PbsnO08976 174 aa22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 ChgbP16014 677 aa22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Fam47cQ14BE7 430 aa22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Grxcr1Q50H32 290 aa22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 MslnQ61468 625 aa22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Amer3Q6NS69 780 aa22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Scaf4Q6PFF0 1209 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm7247Q6UY52 187 aa22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm6377Q8BHV4 303 aa22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Thoc1Q8R3N6 657 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zkscan3Q91VW9 553 aa22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zfp773Q9CZ29 471 aa22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rpn2Q9DBG6 631 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 CtsmQ9JL96 333 aa22.11■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Skint11A7XV14 364 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Rab10P61027 200 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ccdc185Q3V118 621 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Krba1Q6NXZ1 1043 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Zbtb24Q80X44 710 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Elmo2Q8BHL5 732 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Suds3Q8BR65 328 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 StambpQ9CQ26 424 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Snrnp48Q9D361 337 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Asap1Q9QWY8 1147 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Coro1cQ9WUM4 474 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gria4Q9Z2W8 902 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Myo7aP97479 2215 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 TriobpQ99KW3 2014 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Gm1141B9EJU1 475 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 P01740 135 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Pabpc1P29341 636 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Serpina3cP29621 417 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tmem207P86045 143 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 LchnQ3UHG7 455 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 C2cd2lQ80X80 706 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 B3gnt5Q8BGY6 376 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Atg16l1Q8C0J2 607 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Vps37cQ8R105 352 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Ilf2Q9CXY6 390 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 EefsecQ9JHW4 583 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 CtsrQ9JIA9 334 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Nt5cQ9JM14 200 aa22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Igkv12-98A0A0G2JGF9 115 aa22.09■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Socs5O54928 536 aa22.09■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Hmx2P43687 273 aa22.09■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Adam2Q60718 735 aa22.09■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Tmcc1Q69ZZ6 649 aa22.09■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Xlr3bQ6P205 226 aa22.09■■□□□ 1.13
Opn3-201ENSMUST00000027809 Arhgef38Q80VK6 770 aa22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.1 ms