RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rab42Q0PD08 215 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stxbp2Q64324 593 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q6GQV0 436 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tatdn1Q6P8M1 295 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fnip2Q80TD3 1108 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc41a1Q8BJA2 512 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cars2Q8BYM8 551 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r79Q8R285 306 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cant1Q8VCF1 403 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Itgbl1Q8VDV0 494 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rgs10Q9CQE5 181 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Efcab1Q9D3N2 212 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ndel1Q9ERR1 345 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Txnrd2Q9JLT4 524 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rdh11Q9QYF1 316 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fbxo8Q9QZN3 319 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 DgkeQ9R1C6 564 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tnip3A0A1D5RMN0 279 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc4a11A2AJN7 862 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8267E9Q207 261 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P01670 111 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P01671 111 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P01672 111 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cpa3P15089 417 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FesP16879 822 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Clk1P22518 483 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Shmt1P50431 478 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hpcal1P62748 193 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Neurl1bQ0MW30 546 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MamstrQ0ZCJ7 421 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zmat1Q3V0C1 714 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Glp2rQ5IXF8 512 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ahcyl2Q68FL4 613 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rpf1Q7TND5 349 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arhgap15Q811M1 481 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 QpctlQ8BH73 383 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcdh20Q8BIZ0 952 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Amer2Q8CCJ4 672 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Steap3Q8CI59 488 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc47a1Q8K0H1 567 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Elf5Q8VDK3 253 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam49bQ921M7 324 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam83dQ9D7I8 585 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PgdQ9DCD0 483 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyhr1Q9QXA1 311 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Osbpl10S4R1M9 766 aa9.98□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lcn5A2AJB7 192 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Clrn2B2RVW2 232 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 C87414E9PWI7 475 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Edil3O35474 480 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Npr1P18293 1057 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim40Q3UWA4 246 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cnpy1Q4VAB4 94 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 1810065E05RikQ5NC41 235 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr325Q5NCD2 326 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bhlha9Q5RJB0 231 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lag3Q61790 521 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prkd1Q62101 918 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp3a13Q64464 503 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Epb41l5Q8BGS1 731 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CcnyQ8BGU5 341 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prpf18Q8BM39 342 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fignl1Q8BPY9 683 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ebf4Q8K4J2 599 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zdhhc3Q8R173 299 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ppp1r16bQ8VHQ3 568 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cd209eQ91ZW7 208 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AdprmQ99KS6 340 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nudt17Q9CWD3 296 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Polr3eQ9CZT4 710 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cnbd2Q9D5U8 673 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ddi1Q9DAF3 408 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 St6galnac4Q9R2B6 360 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Btaf1E9QAE3 1848 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm45861A0A1B0GRY3 1923 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r74E9PW21 853 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr376E9Q4M1 320 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm340F6RGI3 1242 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr596F8VQ26 312 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pot1bH7BX60 640 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Btg3P50615 252 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gabarapl2P60521 117 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hdac2P70288 488 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Shcbp1lQ3TTP0 639 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ipcef1Q5DU31 406 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Osbp2Q5QNQ6 908 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Srd5a1Q68FF9 255 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cntn4Q69Z26 1026 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vac14Q80WQ2 782 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AardQ811W1 167 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr854Q8VFF1 315 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr985Q8VGB4 311 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gadd45gip1Q9CR59 222 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp655Q9CZP3 541 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dlgap1Q9D415 992 aa9.97□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Msl3Q9WVG9 525 aa9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.8 ms