RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ska2Q9CR46 120 aa16.14■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Prss23Q9D6X6 382 aa16.14■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tbc1d20Q9D9I4 402 aa16.14■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Csnk1dQ9DC28 415 aa16.14■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Adam21Q9JI76 729 aa16.14■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 CtsmQ9JL96 333 aa16.14■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Spry1Q9QXV9 313 aa16.14■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Grm3Q9QYS2 879 aa16.14■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Il17dA0A0B4J1G4 205 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp169E9Q3R6 731 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn1r76F8VQ63 324 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm4847G3X946 537 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm20828J3KMI7 228 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 5730507C01RikJ3QPX0 416 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm2888K7N746 267 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 GzmkO35205 263 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Myl2P51667 166 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Dsc3P55850 896 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 ScinQ60604 715 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atg16l2Q6KAU8 623 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ssx9Q6XAS3 170 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sfr1Q8BP27 319 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 TbcdQ8BYA0 1196 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Washc5Q8C2E7 1159 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp566Q8VCI1 386 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mtfr2Q8VED8 361 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp773Q9CZ29 471 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mrps33Q9D2R8 106 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 PdiltQ9DAN1 588 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tm9sf1Q9DBU0 606 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Actn2Q9JI91 894 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Net1Q9Z206 595 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Col4a4Q9QZR9 1682 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm9573F7C950 1606 aa16.13■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Man1b1A2AJ15 658 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam46dB1ATX6 390 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tsga10ipF7A1F0 157 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm6408J3QNG1 320 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm3402K7N5P2 326 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sypl1O09117 261 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cyp4a14O35728 507 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Grk4O70291 574 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cd4P06332 457 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 UmpsP13439 481 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Aldh3a1P47739 453 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 S100bP50114 92 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 NcstnP57716 708 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ctps1P70698 591 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Adra1dP97714 562 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 CamkmtQ3U2J5 323 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 StradaQ3UUJ4 431 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 StyxQ60969 223 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Bcl2l1Q64373 233 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Krt77Q6IFZ6 572 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cep104Q80V31 926 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Susd6Q8BGE4 302 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pggt1bQ8BUY9 377 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ttc34Q8C0Q3 554 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cfap61Q8CEL2 1252 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lrrc42Q8R2U7 421 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Grk2Q99MK8 689 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lsm7Q9CQQ8 103 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Bcl7aQ9CXE2 210 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Spc24Q9D083 201 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 RhojQ9ER71 214 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pias4Q9JM05 507 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tdrd6P61407 2134 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdh23Q99PF4 3354 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Smok3aC0HKC8 504 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Smok3bC0HKC9 504 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ddx43D3Z6P9 646 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pdzd7E9Q9W7 1021 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tekt5G5E8A8 557 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Snrpd1P62315 119 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ldb1P70662 411 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Armc7Q3UJZ3 198 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slfn4Q3UV66 602 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp791Q497V9 528 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 PtprrQ62132 656 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Casc4Q6P2L7 435 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Slc39a10Q6P5F6 833 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm7247Q6UY52 187 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Abi3Q8BYZ1 367 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lrrtm3Q8BZ81 582 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn1r206Q8R277 312 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nae1Q8VBW6 534 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ackr4Q924I3 350 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vsig1Q9D2J4 407 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ttyh1Q9D3A9 450 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn1r49Q9WUF1 310 aa16.12■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Szt2A2A9C3 3431 aa16.11■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn2r116E9Q6I0 856 aa16.11■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm45837F7D3W5 961 aa16.11■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cyp2j12G3UXT0 502 aa16.11■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ebf3O08791 596 aa16.11■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 RaxO35602 342 aa16.11■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cxcr3O88410 367 aa16.11■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Traf2P39429 501 aa16.11■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 Hspa4lP48722 838 aa16.11■□□□□ 0.17
Casq1-201ENSMUST00000003554 PtpaP58389 323 aa16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.6 ms