RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 ERAP2Q6P179 960 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 TSSK4Q6SA08 328 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 USP45Q70EL2 814 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 LINC00523Q86TU6 105 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 TTC7BQ86TV6 843 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 FAM124AQ86V42 546 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 HOOK3Q86VS8 718 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 RASSF3Q86WH2 238 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 C1orf210Q8IVY1 113 aa8.56□□□□□ -1.04
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SGMS1-211ENST00000626236 DNAAF3Q8N9W5 541 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 DTWD2Q8NBA8 298 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 BBOF1Q8ND07 529 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 OR52K1Q8NGK4 314 aa8.56□□□□□ -1.04
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SGMS1-211ENST00000626236 SMIM14Q96QK8 99 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 EPB41L5Q9HCM4 733 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 CD93Q9NPY3 652 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
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SGMS1-211ENST00000626236 WHRNQ9P202 907 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 SERGEFQ9UGK8 458 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 ITM2BQ9Y287 266 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa8.56□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 BPTFQ12830 3046 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0J9YYE9 177 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 CAPN8A6NHC0 703 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 A8MX80 341 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD66B4E2M5 251 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 NEMP1O14524 444 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 AVILO75366 819 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 TRBC1P01850 177 aa8.55□□□□□ -1.04
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SGMS1-211ENST00000626236 PIRTP0C851 137 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 TPH1P17752 444 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 NFKBIAP25963 317 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 AVPR2P30518 371 aa8.55□□□□□ -1.04
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SGMS1-211ENST00000626236 PLTPP55058 493 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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SGMS1-211ENST00000626236 KBTBD6Q86V97 674 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 MCUQ8NE86 351 aa8.55□□□□□ -1.04
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SGMS1-211ENST00000626236 SEC14L1Q92503 715 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 UBXN4Q92575 508 aa8.55□□□□□ -1.04
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SGMS1-211ENST00000626236 ITM2CQ9NQX7 267 aa8.55□□□□□ -1.04
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SGMS1-211ENST00000626236 EBF1Q9UH73 591 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 GGT7Q9UJ14 662 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 FZD4Q9ULV1 537 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 SHOC2Q9UQ13 582 aa8.55□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 PLXNA2O75051 1894 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0U1RQS6 177 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 PRR23AA6NEV1 266 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 FAM47DPA6NHR8 397 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 PRR33A8MZF0 331 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 AP3B1O00203 1094 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 AXIN1O15169 862 aa8.54□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 TP73O15350 636 aa8.54□□□□□ -1.04
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