RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 CFAP69A5D8W1 941 aa30.87■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 SIGLEC6O43699 453 aa30.87■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 DKK1O94907 266 aa30.87■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 PGLSO95336 258 aa30.87■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 JUNDP17535 347 aa30.87■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 FECHP22830 423 aa30.87■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 DYNLT1P63172 113 aa30.87■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 INPP5AQ14642 412 aa30.87■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 ARMC12Q5T9G4 340 aa30.87■■■□□ 2.53
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CMTM4-204ENST00000563952 NPNTQ6UXI9 565 aa30.87■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 SPOCK2Q92563 424 aa30.87■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 PHTF1Q9UMS5 762 aa30.87■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
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CMTM4-204ENST00000563952 TOR1BO14657 336 aa30.86■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 PSTPIP1O43586 416 aa30.86■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 HLA-DQB2P05538 268 aa30.86■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 C1QTNF9P0C862 333 aa30.86■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
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CMTM4-204ENST00000563952 AGERQ15109 404 aa30.86■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa30.86■■■□□ 2.53
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CMTM4-204ENST00000563952 RAD9BQ6WBX8 426 aa30.85■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 MACC1Q6ZN28 852 aa30.85■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 RBFAQ8N0V3 343 aa30.85■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 AMACRQ9UHK6 382 aa30.85■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 OR1A2Q9Y585 309 aa30.85■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 TPRP12270 2363 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
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CMTM4-204ENST00000563952 RFPL3O75679 317 aa30.84■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 JCHAINP01591 159 aa30.84■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 ALPPL2P10696 532 aa30.84■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 CTPS1P17812 591 aa30.84■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 ACADVLP49748 655 aa30.84■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 AP1B1Q10567 949 aa30.84■■■□□ 2.53
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CMTM4-204ENST00000563952 PROX2Q3B8N5 592 aa30.84■■■□□ 2.53
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CMTM4-204ENST00000563952 C11orf63Q6NUN7 778 aa30.84■■■□□ 2.53
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CMTM4-204ENST00000563952 LMX1AQ8TE12 382 aa30.84■■■□□ 2.53
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CMTM4-204ENST00000563952 SCAMP1O15126 338 aa30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 PDHA1P08559 390 aa30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 CKMT2P17540 419 aa30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 GM2AP17900 193 aa30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 CES1P23141 567 aa30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 PDK1Q15118 436 aa30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 PTPRRQ15256 657 aa30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 CNGA3Q16281 694 aa30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 FAXCQ5TGI0 409 aa30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 DAAM2Q86T65 1068 aa30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 PHACTR4Q8IZ21 702 aa30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 SPC24Q8NBT2 197 aa30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 TPCN2Q8NHX9 752 aa30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 BTN2A2Q8WVV5 523 aa30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 GATA6Q92908 595 aa30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 NLGN3Q9NZ94 848 aa30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 SALL4Q9UJQ4 1053 aa30.83■■■□□ 2.53
CMTM4-204ENST00000563952 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
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CMTM4-204ENST00000563952 HTR1BP28222 390 aa30.82■■■□□ 2.52
CMTM4-204ENST00000563952 CDKN2BP42772 138 aa30.82■■■□□ 2.52
CMTM4-204ENST00000563952 PEX5P50542 639 aa30.82■■■□□ 2.52
CMTM4-204ENST00000563952 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
CMTM4-204ENST00000563952 DAB2P98082 770 aa30.82■■■□□ 2.52
CMTM4-204ENST00000563952 NIPAL4Q0D2K0 466 aa30.82■■■□□ 2.52
CMTM4-204ENST00000563952 MTM1Q13496 603 aa30.82■■■□□ 2.52
CMTM4-204ENST00000563952 IHHQ14623 411 aa30.82■■■□□ 2.52
CMTM4-204ENST00000563952 KAZNQ674X7 775 aa30.82■■■□□ 2.52
CMTM4-204ENST00000563952 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa30.82■■■□□ 2.52
CMTM4-204ENST00000563952 USP45Q70EL2 814 aa30.82■■■□□ 2.52
CMTM4-204ENST00000563952 ACRBPQ8NEB7 543 aa30.82■■■□□ 2.52
CMTM4-204ENST00000563952 ARRDC2Q8TBH0 407 aa30.82■■■□□ 2.52
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