RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	UPB1	Q9UBR1	384 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	AOX1	Q06278	1338 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PRDM2	Q13029	1718 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GOLGA3	Q08378	1498 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	NES	P48681	1621 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CPLX1	O14810	134 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNAB3	O43448	404 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	EXOC3	O60645	756 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	NDUFS3	O75489	264 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KAT7	O95251	611 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	C22orf31	O95567	290 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TTLL1	O95922	423 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	IL7R	P16871	459 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM11	P17152	192 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ENG	P17813	658 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	FPR3	P25089	353 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	MC5R	P33032	325 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP2C18	P33260	490 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT2	P35908	639 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GJC1	P36383	396 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PRKCI	P41743	596 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	JAK3	P52333	1124 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	OAZ1	P54368	228 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GALC	P54803	685 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	GPC5	P78333	572 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SHC2	P98077	582 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	LMAN2	Q12907	356 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ALCAM	Q13740	583 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	IL11RA	Q14626	422 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PPA1	Q15181	289 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SMU1	Q2TAY7	513 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PARP10	Q53GL7	1025 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	MPP7	Q5T2T1	576 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TEX9	Q8N6V9	391 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PTER	Q96BW5	349 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF27	Q86VH2	1401 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702		A4D1N5	150 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC69	A6NI79	296 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	STX6	O43752	255 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	KERA	O60938	352 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM49B-222	ENST00000522702	AVIL	O75366	819 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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