RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 CDK18Q07002 472 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 TIGD2Q4W5G0 525 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 MARCH8Q5T0T0 291 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 RGMBQ6NW40 437 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ZFP1Q6P2D0 407 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD23Q86SG2 305 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 OR4K2Q8NGD2 314 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 OR13C4Q8NGS5 318 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.351e-6■■□□□ 13.1
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RABGEF1-211ENST00000503687 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 SPAG4Q9NPE6 437 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 TRIM38O00635 465 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 MATN3O15232 486 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 CLOCKO15516 846 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ASGR1P07306 291 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 FASP25445 335 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 RHOAP61586 193 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 VEPH1Q14D04 833 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP1R3AQ16821 1122 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 C14orf80Q86SX3 495 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 HERC6Q8IVU3 1022 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 RAP1GDS1P52306 607 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 SEMG2Q02383 582 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 LAMB3Q13751 1172 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 GSTA3Q16772 222 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF180Q86T96 592 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 STK32CQ86UX6 486 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM126BQ8IXS8 530 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ZFP14Q9HCL3 533 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 RIC8BQ9NVN3 520 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 GDAP2Q9NXN4 497 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 STK39Q9UEW8 545 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ARL5AQ9Y689 179 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 F8W810 466 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR32O75388 356 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 FKBP9O95302 570 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 WEE1P30291 646 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 CCNFP41002 786 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 CLCN5P51795 746 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 IL27RAQ6UWB1 636 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 FKBP9P1Q75LS8 142 aa12.84□□□□□ -0.35
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RABGEF1-211ENST00000503687 SLC9A7Q96T83 725 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 GIT1Q9Y2X7 761 aa12.84□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A0J9YYE9 177 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 KANSL1LA0AUZ9 987 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 PTGESO14684 152 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 CNTN5O94779 1100 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 CCNCP24863 283 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 RPL9P32969 192 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 METTL21CQ5VZV1 264 aa12.83□□□□□ -0.36
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RABGEF1-211ENST00000503687 SATB1Q01826 763 aa12.83□□□□□ -0.36
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RABGEF1-211ENST00000503687 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 SNX5Q9Y5X3 404 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC154A6NI56 674 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 H3BMM5 538 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 IRAK2O43187 625 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 OR6B1O95007 311 aa12.83□□□□□ -0.36
RABGEF1-211ENST00000503687 LBPP18428 481 aa12.83□□□□□ -0.36
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