RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTSS1LQ765P7 747 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXL8Q96CD0 374 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DUX5Q96PT3 197 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SIN3AQ96ST3 1273 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WASH6PQ9NQA3 447 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDC14AQ9UNH5 594 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DOCK7Q96N67 2140 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 hDV102S1A0JD36 115 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LDLRAD4O15165 306 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTA2O94776 668 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MMP2P08253 660 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POU1F1P28069 291 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTP4A2Q12974 167 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITGADQ13349 1161 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC39A14Q15043 492 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AMZ1Q400G9 498 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF125Q96EQ8 232 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADGRG7Q96K78 797 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLHL15Q96M94 604 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BBS4Q96RK4 519 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNN2Q9H2S1 579 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAGEE1Q9HCI5 957 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOX4Q9NPH5 578 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC13A4Q9UKG4 626 aa4.6□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLSCR5A0PG75 271 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDUFS7O75251 213 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AFPP02771 609 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TFP02787 698 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD58P19256 250 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PEX5P50542 639 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNTA1Q13424 505 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MMEL1Q495T6 779 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RRM2BQ7LG56 351 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC35F3Q8IY50 421 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ESX1Q8N693 406 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AGBL3Q8NEM8 1001 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CREB3L4Q8TEY5 395 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ST8SIA4Q92187 359 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BICD1Q96G01 975 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PKP4Q99569 1192 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCND2Q9NZV8 630 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MPP6Q9NZW5 540 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A4GNTQ9UNA3 340 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM96BQ9Y3D0 163 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DENND3A2RUS2 1198 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAGEA13PA6NCF6 341 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSPAN4O14817 238 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLDN14O95500 239 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 F9P00740 461 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ECT2LQ008S8 904 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POU5F1BQ06416 359 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NEDD9Q14511 834 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP2R5BQ15173 497 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OASLQ15646 514 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CALCRLQ16602 461 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TCTN1Q2MV58 587 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINGO2Q7L985 606 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TDRPQ86YL5 185 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOXRED2Q8IWF2 684 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCCPDHQ8NBX0 429 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BEST2Q8NFU1 509 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGSF21Q96ID5 467 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF570Q96NI8 536 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLITRK1Q96PX8 696 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CSF3RQ99062 836 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AGXT2Q9BYV1 514 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPRY4Q9C004 299 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TKTL2Q9H0I9 626 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNG2Q9UJ96 466 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRYL1Q9Y2S2 319 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNX9Q9Y5X1 595 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STON1Q9Y6Q2 735 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCN5AQ14524 2016 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms