RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 STK40Q8N2I9 435 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 IPMKQ8NFU5 416 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ACOX2Q99424 681 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 NAT9Q9BTE0 207 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 HDAC8Q9BY41 377 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 CASS4Q9NQ75 786 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 BFARQ9NZS9 450 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.78□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 ASPMQ8IZT6 3477 aa11.77□□□□□ -0.52
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PQF6 199 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD66B4E2M5 251 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SLC7A4O43246 635 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 BNIP3LO60238 219 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ADAM23O75077 832 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 LEFTY1O75610 366 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CPP00450 1065 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 MAGEA3P43357 314 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 FNTBP49356 437 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CCR3P51677 355 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 EPHB1P54762 984 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PLTPP55058 493 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TRAF2Q12933 501 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CRY1Q16526 586 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 HIF1AQ16665 826 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 MAP9Q49MG5 647 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 FAXCQ5TGI0 409 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 USP45Q70EL2 814 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CENPUQ71F23 418 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 NLRP9Q7RTR0 991 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 KBTBD6Q86V97 674 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CAMK1DQ8IU85 385 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 RELL1Q8IUW5 271 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CAMKK1Q8N5S9 505 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PAF1Q8N7H5 531 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 DNAAF3Q8N9W5 541 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CHST14Q8NCH0 376 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 IFT81Q8WYA0 676 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PEX13Q92968 403 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 LYSMD1Q96S90 227 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 FMO2Q99518 471 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 FICDQ9BVA6 458 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 IL22Q9GZX6 179 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 MAGEE1Q9HCI5 957 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CD248Q9HCU0 757 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 UBP1Q9NZI7 540 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 RAB21Q9UL25 225 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 RIMKLBQ9ULI2 386 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa11.77□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SHROOM3Q8TF72 1996 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SDR42E2A6NKP2 422 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 E7ESA3 106 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TP73O15350 636 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 HRO43593 1189 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 AP1G1O43747 822 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 LRP3O75074 770 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 AGTP01019 485 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PRLP01236 227 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 IL1BP01584 269 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 DNTTP04053 509 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 UGT2B4P06133 528 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 XPAP23025 273 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CXCL12P48061 93 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 NEK3P51956 506 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 COPAP53621 1224 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ELP6Q0PNE2 266 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SLMAPQ14BN4 828 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CST6Q15828 149 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PCSK7Q16549 785 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 DENND5AQ6IQ26 1287 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ERAP2Q6P179 960 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ZDHHC24Q6UX98 284 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 USP30Q70CQ3 517 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 ZNF366Q8N895 744 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 FBXO25Q8TCJ0 367 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 BRSK1Q8TDC3 778 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 PIH1D2Q8WWB5 315 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 VOPP1Q96AW1 172 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SCRN2Q96FV2 425 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 KLHL32Q96NJ5 620 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 SERPINB12Q96P63 405 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 RANBP9Q96S59 729 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 KDM4CQ9H3R0 1056 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 KCTD5Q9NXV2 234 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 FZD4Q9ULV1 537 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 CHKBQ9Y259 395 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa11.76□□□□□ -0.53
NISCH-211ENST00000488243 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms