RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409178.5

C10orf55-201, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C10orf55, Length 2,513 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-201ENST00000409178 KLC3Q6P597 504 aa21.7■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.7■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 SLC14A2Q15849 920 aa21.69■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 PPP1R3AQ16821 1122 aa21.69■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 GK5Q6ZS86 529 aa21.69■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 CUZD1Q86UP6 607 aa21.69■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 TSPAN17Q96FV3 270 aa21.69■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 MARCH5Q9NX47 278 aa21.69■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 STK39Q9UEW8 545 aa21.69■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 A0A0D9SEW6 157 aa21.69■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 TRPC5OSA6NMA1 111 aa21.69■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 SLC22A2O15244 555 aa21.69■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 DUSP4Q13115 394 aa21.69■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 PARP15Q460N3 678 aa21.69■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 TLR5O60602 858 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 GOT2P00505 430 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 TNK2Q07912 1038 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 SEMA3AQ14563 771 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 ACAP2Q15057 778 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF423Q2M1K9 1284 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 RTP2Q5QGT7 225 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 PDSS2Q86YH6 399 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 ABI1Q8IZP0 508 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 SNX31Q8N9S9 440 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 PHC3Q8NDX5 983 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 OR13C4Q8NGS5 318 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 SPPL2BQ8TCT7 592 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 STON2Q8WXE9 905 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 IFT43Q96FT9 208 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 WDR41Q9HAD4 459 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 DONSONQ9NYP3 566 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 TCAF2A6NFQ2 919 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 OR6C75A6NL08 312 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 PRAMEF11O60813 436 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 PRSS56P0CW18 603 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 TACR2P21452 398 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 CEACAM7Q14002 265 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF235Q14590 738 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 TRIP10Q15642 601 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 PIGGQ5H8A4 983 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF549Q6P9A3 640 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 LGI2Q8N0V4 545 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 PELI3Q8N2H9 469 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 OR52K2Q8NGK3 314 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 EXT2Q93063 718 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 SCOCQ9UIL1 159 aa21.68■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 MT-CO1P00395 513 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 RBP1P09455 135 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 SLC11A1P49279 550 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 AQP4P55087 323 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 HERC3Q15034 1050 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 OR52E8Q6IFG1 317 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 CEP70Q8NHQ1 597 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 PTERQ96BW5 349 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 FGFR3P22607 806 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 SLC6A4P31645 630 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 ART3Q13508 389 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 CLEC6AQ6EIG7 209 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 TAS1R1Q7RTX1 841 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 ISCA2Q86U28 154 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 HMGCLL1Q8TB92 370 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 SERPINI1Q99574 410 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 YIPF3Q9GZM5 350 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 GSTO2Q9H4Y5 243 aa21.67■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC162PA2VCL2 907 aa21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 ZCCHC18P0CG32 403 aa21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 MS4A2Q01362 244 aa21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 GALNT7Q86SF2 657 aa21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 PGAM4Q8N0Y7 254 aa21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 OR7D4Q8NG98 312 aa21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 CASD1Q96PB1 797 aa21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 KLHL4Q9C0H6 718 aa21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 A0A1W2PQY0 241 aa21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 MAGEA13PA6NCF6 341 aa21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC126Q96EE4 140 aa21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 NSMCE3Q96MG7 304 aa21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 VCXQ9H320 206 aa21.66■■□□□ 1.06
C10orf55-201ENST00000409178 PDFQ9HBH1 243 aa21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms