RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 SPON1Q9HCB6 807 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ZNF510Q9Y2H8 683 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SNAP29O95721 258 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 CCR1P32246 355 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 HALP42357 657 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 RPS9P46781 194 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 DNASE1L3Q13609 305 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 STXBP5Q5T5C0 1151 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SPESP1Q6UW49 350 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 CEP97Q8IW35 865 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TMEM174Q8WUU8 243 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 AFG1LQ8WV93 481 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PPM1MQ96MI6 270 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 RECQL4O94761 1208 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 IPO13O94829 963 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ARIH2O95376 493 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SLC1A2P43004 574 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 CLK1P49759 484 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SEPHS1P49903 392 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 MBTD1Q05BQ5 628 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TGFBIQ15582 683 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TAF2Q6P1X5 1199 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SLC26A9Q7LBE3 791 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SFRP1Q8N474 314 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PSMA8Q8TAA3 256 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TMEM74Q96NL1 305 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 BDH2Q9BUT1 245 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 NACA2Q9H009 215 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ABCG8Q9H221 673 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PDZD7Q9H5P4 517 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 GAS2O43903 313 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 GSRP00390 522 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 RBP1P09455 135 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 IQCF3P0C7M6 154 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 NOS2P35228 1153 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TAZQ16635 292 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TMTC4Q5T4D3 741 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 RGS18Q9NS28 235 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PIGVQ9NUD9 493 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa15.36■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TAF6P49848 677 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ENPEPQ07075 957 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SEPT8Q92599 483 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 C19orf60Q96EN9 201 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TSPAN17Q96FV3 270 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ZNF560Q96MR9 790 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 LIMD1Q9UGP4 676 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 MTSS1O43312 755 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ANXA9O76027 345 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 IL7RP16871 459 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ADRA1BP35368 520 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 C1QTNF8P60827 252 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 RPL26P61254 145 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PCID2Q5JVF3 399 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 MFSD4BQ5TF39 518 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 CRTC3Q6UUV7 619 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 FNDC5Q8NAU1 212 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 CHST13Q8NET6 341 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 FAM162AQ96A26 154 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SPON2Q9BUD6 331 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 HPS4Q9NQG7 708 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 POLE4Q9NR33 117 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ZNF195O14628 629 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SLC35E2BP0CK96 405 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ECT2LQ008S8 904 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 RELAQ04206 551 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 BROXQ5VW32 411 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 CCDC103Q8IW40 242 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 DNERQ8NFT8 737 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 GIPC2Q8TF65 315 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SLC35F5Q8WV83 523 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 KCNA7Q96RP8 456 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ROGDIQ9GZN7 287 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SP110Q9HB58 689 aa15.35■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 OLAHQ9NV23 265 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms