RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 HNF1BP35680 557 aa26.2■■□□□ 1.79
TOMM40-201ENST00000252487 LRRC32Q14392 662 aa26.2■■□□□ 1.79
TOMM40-201ENST00000252487 EOGTQ5NDL2 527 aa26.2■■□□□ 1.79
TOMM40-201ENST00000252487 TRIM67Q6ZTA4 783 aa26.2■■□□□ 1.79
TOMM40-201ENST00000252487 OR2T3Q8NH03 318 aa26.2■■□□□ 1.79
TOMM40-201ENST00000252487 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
TOMM40-201ENST00000252487 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
TOMM40-201ENST00000252487 ANKRD7Q92527 254 aa26.2■■□□□ 1.79
TOMM40-201ENST00000252487 PHACTR1Q9C0D0 580 aa26.2■■□□□ 1.79
TOMM40-201ENST00000252487 SAMD15Q9P1V8 674 aa26.2■■□□□ 1.79
TOMM40-201ENST00000252487 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa26.2■■□□□ 1.79
TOMM40-201ENST00000252487 PHTF1Q9UMS5 762 aa26.2■■□□□ 1.79
TOMM40-201ENST00000252487 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 ITGB7P26010 798 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 SSTR1P30872 391 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 GPX6P59796 221 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 RPL26P61254 145 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 RPS14P62263 151 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 CST6Q15828 149 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 UGP2Q16851 508 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 BRAT1Q6PJG6 821 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 TSPAN33Q86UF1 283 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 ITM2BQ9Y287 266 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 TCAF1Q9Y4C2 921 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 BPTFQ12830 3046 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 AP3B1O00203 1094 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 CCL22O00626 93 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 NMBRP28336 390 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 HSD17B3P37058 310 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 PCID2Q5JVF3 399 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 UNC5AQ6ZN44 842 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 TTC7BQ86TV6 843 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 RELL1Q8IUW5 271 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 AADATQ8N5Z0 425 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 MFSD3Q96ES6 412 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 PCDH12Q9NPG4 1184 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 DKK3Q9UBP4 350 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 SERGEFQ9UGK8 458 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 GGT7Q9UJ14 662 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 SOX13Q9UN79 622 aa26.19■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 CAPN8A6NHC0 703 aa26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 UPK3BL1B0FP48 263 aa26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 UPK3BL2E5RIL1 263 aa26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 FAM193AP78312 1265 aa26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 CNTN1Q12860 1018 aa26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 CBLBQ13191 982 aa26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 CEP128Q6ZU80 1094 aa26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 TMPRSS6Q8IU80 811 aa26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 PALM2Q8IXS6 379 aa26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 UNC5BQ8IZJ1 945 aa26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 PJA1Q8NG27 643 aa26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 LRRC39Q96DD0 335 aa26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 VPS37BQ9H9H4 285 aa26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 ARFGAP3Q9NP61 516 aa26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 B4GALT6Q9UBX8 382 aa26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF711Q9Y462 761 aa26.18■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 LDB2O43679 373 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 PGAM1P18669 254 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 ADRA1DP25100 572 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 CRY1Q16526 586 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 KIFC1Q9BW19 673 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 GOLGA8CPA6NN73 597 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 SPINT1O43278 529 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 RIPK2O43353 540 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 TTC4O95801 387 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 LHCGRP22888 699 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 XPAP23025 273 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 DRD3P35462 400 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 TMPRSS15P98073 1019 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 BRSK1Q8TDC3 778 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 SPOCK2Q92563 424 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 EID2BQ96D98 161 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 DYRK4Q9NR20 520 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa26.17■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 TTC28Q96AY4 2481 aa26.16■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa26.16■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 HEATR9A2RTY3 570 aa26.16■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 DYNC1I1O14576 645 aa26.16■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 PIAS1O75925 651 aa26.16■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 CLDN7O95471 211 aa26.16■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 DCNP07585 359 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 P2RY2P41231 377 aa26.16■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 CRYMQ14894 314 aa26.16■■□□□ 1.78
TOMM40-201ENST00000252487 FAM46CQ5VWP2 391 aa26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms