RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 EPHB1P54762 984 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 NRLP54845 237 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 NKX3-2P78367 333 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 METTL7BQ6UX53 244 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 RFX8Q6ZV50 586 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 DSELQ8IZU8 1212 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 LRRC40Q9H9A6 602 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 LRRC4Q9HBW1 653 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 CASS4Q9NQ75 786 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 WDR27A2RRH5 827 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 EVPLLA8MZ36 301 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 PSMD11O00231 422 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 SNAP91O60641 907 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 CSPG5O95196 566 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 NCAM1P13591 858 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 TTKP33981 857 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 STAT5BP51692 787 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 DNAJB13P59910 316 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 MTMR2Q13614 643 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 FLOT2Q14254 428 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 ZBED5Q49AG3 693 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 IGSF11Q5DX21 431 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 LIPMQ5VYY2 423 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 CHSY3Q70JA7 882 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 SLC35F5Q8WV83 523 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 MAP6Q96JE9 813 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 PNPLA3Q9NST1 481 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 DTLQ9NZJ0 730 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 HSPA4LO95757 839 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 ICAM2P13598 275 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 GABRB3P28472 473 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 ADORA2AP29274 412 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 RAP1GAPP47736 663 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 PHC1P78364 1004 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 GALK2Q01415 458 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 PSMD5Q16401 504 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 DCAF15Q66K64 600 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 PELI3Q8N2H9 469 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 ANKFN1Q8N957 763 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 TANKQ92844 425 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 GCNAQ96QF7 691 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 TARM1B6A8C7 271 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 H3BNH8 94 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 DCXO43602 365 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 PI15O43692 258 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 ATF6P18850 670 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 TRIM23P36406 574 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 TSPAN7P41732 249 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 RPL14P50914 215 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 RBP5P82980 135 aa6.33□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF33AQ06730 810 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms