RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032487.13

Vamp1-201, Transcript of Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vamp1, Length 2,772 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Aph1bQ8C7N7 257 aa11.69□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vps37aQ8CHS8 397 aa11.69□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Klf11Q8K1S5 502 aa11.69□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pomgnt1Q91X88 660 aa11.69□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 FdpsQ920E5 353 aa11.69□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gprc5bQ923Z0 410 aa11.69□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tchhl1Q9D3P1 638 aa11.69□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cyp2c55Q9D816 490 aa11.69□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ddx21Q9JIK5 851 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Homer2Q9QWW1 354 aa11.69□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Morf4l2Q9R0Q4 288 aa11.69□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tle2Q9WVB2 767 aa11.69□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Speer4cG3UXD1 256 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 SpibO35906 267 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dpf3P58269 378 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 PdxpP60487 292 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 NxnP97346 435 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pla2g6P97819 807 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Znf746Q3U133 652 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dsg1aQ61495 1057 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Itga7Q61738 1179 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ifngr2Q63953 332 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tfdp2Q64163 446 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Kiaa1841Q68FF0 718 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gba2Q69ZF3 918 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc39a10Q6P5F6 833 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gpr151Q7TSN6 422 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Hmbox1Q8BJA3 419 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Bri3bpQ8BXV2 253 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Yod1Q8CB27 343 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tprg1Q8CB49 279 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ppp1r14cQ8R4S0 164 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc35a5Q921R7 437 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 KlbQ99N32 1043 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Idh3aQ9D6R2 366 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fam162aQ9D6U8 155 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ppp1r2Q9DCL8 206 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 SktA2AQ25 1946 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nlrp12E9Q5R7 1054 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zc3h12bG3X9I7 835 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1121L7MTT1 314 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 ArP19091 899 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 C2P21180 760 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gpc4P51655 557 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Hsd17b3P70385 305 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 CrtamQ149L7 389 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 9130409I23RikQ3TS87 320 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sfi1Q3UZY0 1216 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Oog4Q4G0C7 502 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rab34Q64008 259 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Podnl1Q6P3Y9 559 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pik3c3Q6PF93 887 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Letm2Q7TNU7 480 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sel1l3Q80TS8 1137 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sephs1Q8BH69 392 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 LdahQ8BVA5 326 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Parp12Q8BZ20 711 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rnf8Q8VC56 488 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr441Q8VFS5 310 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1499Q8VG65 314 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 WacQ924H7 646 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 NosipQ9D6T0 301 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vwa7Q9JHA8 891 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Orc6Q9WUJ8 262 aa11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 RbpmsQ9WVB0 197 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm28363A0A087WQW2 129 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm30302A0A1Y7VN40 1110 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sgo2bJ3QMK1 1167 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn2r5K7N788 911 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm6351K9J7D1 481 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 GzmdP11033 252 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Adra1dP97714 562 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ptgs2Q05769 604 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fam47cQ14BE7 430 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc22a23Q3UHH2 689 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fam83fQ3UKU4 495 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Kbtbd8Q3UQV5 599 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 CybbQ61093 570 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tas2r102Q7M717 329 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Raver2Q7TPD6 673 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr533Q7TRT7 320 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vat1lQ80TB8 417 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmem214Q8BM55 687 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mbtps2Q8CHX6 515 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cyp4f13Q99N19 523 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 PrameQ9D4Z5 464 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Kbtbd12Q9D618 625 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 TcimQ9D915 106 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ngly1Q9JI78 651 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ing1Q9QXV3 279 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sbno2Q7TNB8 1349 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Arhgef10lA2AWP8 1280 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Trim5E9PV98 497 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tnfrsf11bO08712 401 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cyp2b19O55071 492 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Hcn1O88704 910 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fgfr2P21803 821 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Asgr1P34927 284 aa11.67□□□□□ -0.54
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ndst2P52850 883 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.1 ms