RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029907.5

Ubxn2b-201, Transcript of UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn2b, Length 6,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Dab2P98078 766 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Cage1Q5IR70 849 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 TCAIMQ66JZ4 499 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Zmpste24Q80W54 475 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Suds3Q8BR65 328 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ccdc142Q8CAI1 738 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Fads1Q920L1 447 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 RragcQ99K70 398 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Actl7aQ9QY84 440 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Cyp2w1E9Q816 493 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ap3d1O54774 1199 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pou5f1P20263 352 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gucy2eP52785 1108 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Rbp1Q00915 135 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 GaltQ03249 379 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 9930111J21Rik1Q5SVP0 844 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Xlr3aQ60595 226 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 BoraQ8BS90 525 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Csnk1g3Q8C4X2 424 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Parp9Q8CAS9 866 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 PdiltQ9DAN1 588 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ddx59Q9DBN9 619 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Atp6v1c1Q9Z1G3 382 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pik3cdO35904 1043 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Hmga1P17095 107 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 PpargP37238 505 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 ThraP63058 492 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Dnajb14Q149L6 379 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Zfp217Q3U0X6 1041 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Rabl6Q5U3K5 725 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Cox8aQ64445 69 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ppm1lQ8BHN0 360 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Wwp1Q8BZZ3 918 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ugt2b1Q8R084 529 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Hacd2Q9D3B1 254 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Cnbd2Q9D5U8 673 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 PalmdQ9JHU2 551 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Sh2d3cQ9QZS8 854 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Med20Q9R0X0 212 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Dthd1E9PZX1 795 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm11239E9Q5Z9 360 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm11237F2Z3W5 360 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm11238F2Z478 360 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Slc6a20bO88575 635 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gsta3P30115 221 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pou3f3P31361 497 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Serpinb5P70124 375 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm428Q3UTE2 360 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Dmc1Q61880 340 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 DseQ8BLI4 958 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pwp2Q8BU03 919 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr695Q8VFM3 315 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pmf1Q9CPV5 202 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Tmem114Q9D563 222 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm14401A2ARV7 303 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Zbed5B2RPU8 756 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr652B9EHE6 318 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm20509G3UZF1 325 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Lsp1P19973 330 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pdha1P35486 390 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Irf7P70434 457 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 PgrQ00175 926 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 CkbQ04447 381 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Slfn4Q3UV66 602 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ces5aQ6AW46 575 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Mtmr12Q80TA6 747 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Fem1cQ8CEF1 617 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Mta1Q8K4B0 715 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Taf12Q8VE65 161 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Duoxa2Q9D311 320 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 IgtpQ9DCE9 423 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 NckipsdQ9ESJ4 714 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ing2Q9ESK4 281 aa9.63□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm3604A0A087WPN2 559 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Hmx2P43687 273 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pitx1P70314 315 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Msx2Q03358 267 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Arhgap17Q3UIA2 846 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 1700001K19RikQ80ZT1 219 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 R3hcc1lQ8BJM3 775 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pcdhb7Q8CDY9 829 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 KmoQ91WN4 479 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 S100pbpQ9D5K4 396 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ppp1r2Q9DCL8 206 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 NfkbizQ9EST8 728 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Plxna3P70208 1872 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Vmn2r24D3YUI0 854 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Plk2P53351 682 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Zfyve27Q3TXX3 415 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 PtprjQ64455 1238 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Serpina12Q7TMF5 413 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Disc1Q811T9 852 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Plin3Q9DBG5 437 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Cldn19Q9ET38 224 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Uts2Q9QZQ3 123 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Plin4O88492 1403 aa9.62□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 9230113P08RikD3YWX3 137 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.9 ms