Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
Plxna3P70208 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Plxna3P70208 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Plxna3P70208 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Plxna3P70208 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Plxna3P70208 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Plxna3P70208 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Plxna3P70208 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Plxna3P70208 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Plxna3P70208 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Plxna3P70208 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Plxna3P70208 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Plxna3P70208 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Plxna3P70208 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Plxna3P70208 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Plxna3P70208 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Plxna3P70208 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Plxna3P70208 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Plxna3P70208 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Plxna3P70208 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Plxna3P70208 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Plxna3P70208 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Plxna3P70208 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Plxna3P70208 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Plxna3P70208 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Plxna3P70208 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Plxna3P70208 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Plxna3P70208 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Plxna3P70208 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Plxna3P70208 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Plxna3P70208 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Plxna3P70208 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Plxna3P70208 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Plxna3P70208 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Plxna3P70208 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Plxna3P70208 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Plxna3P70208 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Plxna3P70208 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Plxna3P70208 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Plxna3P70208 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Plxna3P70208 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Plxna3P70208 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Plxna3P70208 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Plxna3P70208 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Plxna3P70208 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Plxna3P70208 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Plxna3P70208 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Plxna3P70208 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Plxna3P70208 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Plxna3P70208 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Plxna3P70208 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Plxna3P70208 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Plxna3P70208 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Plxna3P70208 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Plxna3P70208 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Plxna3P70208 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Plxna3P70208 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Plxna3P70208 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Plxna3P70208 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Plxna3P70208 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Plxna3P70208 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Plxna3P70208 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Plxna3P70208 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Plxna3P70208 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Plxna3P70208 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Plxna3P70208 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Plxna3P70208 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Plxna3P70208 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Plxna3P70208 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Plxna3P70208 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Plxna3P70208 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Plxna3P70208 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Plxna3P70208 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Plxna3P70208 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Plxna3P70208 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Plxna3P70208 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Plxna3P70208 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Plxna3P70208 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Plxna3P70208 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Plxna3P70208 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Plxna3P70208 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Plxna3P70208 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Plxna3P70208 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Plxna3P70208 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Plxna3P70208 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Plxna3P70208 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Plxna3P70208 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Plxna3P70208 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Plxna3P70208 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Plxna3P70208 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Plxna3P70208 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Plxna3P70208 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Plxna3P70208 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Plxna3P70208 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Plxna3P70208 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Plxna3P70208 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Plxna3P70208 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Plxna3P70208 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Plxna3P70208 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Plxna3P70208 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms