RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 EXOC2Q96KP1 924 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 INSIG1O15503 277 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 GLB1P16278 677 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP9Q49MG5 647 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ERAP2Q6P179 960 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 RXFP2Q8WXD0 754 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 HMCESQ96FZ2 354 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.011e-7■■■□□ 16.1
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEB5Q9BZ81 275 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 APPL1Q9UKG1 709 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 FHOD1Q9Y613 1164 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 SUOXP51687 545 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 NOMO3P69849 1222 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 MAN2A1Q16706 1144 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 CERCAMQ5T4B2 595 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ARCQ7LC44 396 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRED1Q7Z699 444 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 IRF2BP1Q8IU81 584 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 SEMA3CQ99985 751 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDH12Q9NPG4 1184 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 LRIT1Q9P2V4 623 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 PES1O00541 588 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 MMEP08473 750 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 WT1P19544 449 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 LIG3P49916 1009 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 MTM1Q13496 603 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC14Q49A88 953 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM164Q5U3C3 297 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD16Q68DU8 428 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC185Q8N715 623 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 DPEP2Q9H4A9 486 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 MOSPD1Q9UJG1 213 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 NEU3Q9UQ49 428 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PQC6 194 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf172C9J069 976 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 TLE1Q04724 770 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 C14orf28Q4W4Y0 310 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 PAF1Q8N7H5 531 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 HTR3CQ8WXA8 447 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1E3Q8WZA6 343 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 KLC2Q9H0B6 622 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A18Q9H1K4 315 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 SEPT3Q9UH03 358 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 DOCK4Q8N1I0 1966 aa27.56■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKCGP05129 697 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 CD82P27701 267 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 CLCA4Q14CN2 919 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 UGP2Q16851 508 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 AMZ1Q400G9 498 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 SFTPA2Q8IWL1 248 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 OR56A4Q8NGH8 313 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 GPT2Q8TD30 523 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM172AQ8WUF8 416 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 NDST4Q9H3R1 872 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 DGKBQ9Y6T7 804 aa27.55■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 PNLIPP16233 465 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 EPHB2P29323 1055 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPN13Q12923 2485 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 STRADAQ7RTN6 431 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAAF5Q86Y56 855 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 SLITRK4Q8IW52 837 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G15Q8NCC3 412 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 JOSD2Q8TAC2 188 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf70Q9BRQ4 267 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 SEMA6CQ9H3T2 930 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 SUV39H2Q9H5I1 410 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 FGF22Q9HCT0 170 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 LHX3Q9UBR4 397 aa27.54■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 RASA4BC9J798 803 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 RASA4O43374 803 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 KELP23276 732 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP1A2P50993 1020 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 C16orf72Q14CZ0 275 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 VWA3BQ502W6 1294 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 OGFOD3Q6PK18 319 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 DTX1Q86Y01 620 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM114A1Q8IWE2 563 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 FUCA2Q9BTY2 467 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
CAPNS1-217ENST00000629983 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms