RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 KDSRQ06136 332 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 LAMB3Q13751 1172 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 QPCTQ16769 361 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ARMC12Q5T9G4 340 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZVU0 165 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 TERB1Q8NA31 727 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.64e-11■□□□□ 10.6
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 BRWD1Q9NSI6 2320 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC34A8MYJ7 566 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 WASH3PC4AMC7 463 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 MBTPS2O43462 519 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 UGT1A9O60656 530 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 POP4O95707 220 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNA5P22460 613 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINA4P29622 427 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL26P61254 145 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 CNGA3Q16281 694 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 PDPK2PQ6A1A2 396 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 EXOC3L1Q86VI1 746 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNMB4Q86W47 210 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 RASSF3Q86WH2 238 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2A12Q8NGT7 310 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 PIH1D2Q8WWB5 315 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 PEX13Q92968 403 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 UGT1A7Q9HAW7 530 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 UGT1A10Q9HAW8 530 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 UGT1A8Q9HAW9 530 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 SPO11Q9Y5K1 396 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM155BO75949 473 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 PIRTP0C851 137 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 PAMP19021 973 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC8A1P32418 973 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 GRIA4P48058 902 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 KDM1BQ8NB78 822 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM76AQ8TAV0 307 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 MZB1Q8WU39 189 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFATQ9P243 1243 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 RIMKLBQ9ULI2 386 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC8A2Q9UPR5 921 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 BNIP3LO60238 219 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ARNTP27540 789 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 RAD51Q06609 339 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 GRM3Q14832 879 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 EMC10Q5UCC4 262 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 MDGA1Q8NFP4 955 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 OR13J1Q8NGT2 312 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 BRD9Q9H8M2 597 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC17A6Q9P2U8 582 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 PLA2G4CQ9UP65 541 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ARL5AQ9Y689 179 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXO6A8MYZ6 492 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 C2CD4DB7Z1M9 353 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 VAPBO95292 243 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 CRTAMO95727 393 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 NR1D1P20393 614 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ST8SIA6P61647 398 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ACVR1Q04771 509 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 TRABD2AQ86V40 505 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ECHDC3Q96DC8 303 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 SMIM14Q96QK8 99 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 SUV39H2Q9H5I1 410 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD3Q9Y597 815 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTL7BQ9Y614 415 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-215ENST00000628018 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 EPHB1P54762 984 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 TAOK1Q7L7X3 1001 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 SFTPA1Q8IWL2 248 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 CHST14Q8NCH0 376 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPRN2Q92932 1015 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 AGAP2Q99490 1192 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 PSAT1Q9Y617 370 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D3BA6NDS4 549 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 AURKAO14965 403 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT15P19012 456 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-215ENST00000628018 HPDP32754 393 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
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