RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556700.5

NUMB-222, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 4

Gene NUMB, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-222	ENST00000556700	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	USP29	Q9HBJ7	922 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	DYRK4	Q9NR20	520 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	BNIP3L	O60238	219 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	MT-CO1	P00395	513 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	PRNP	P04156	253 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ITGB6	P18564	788 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	SLC1A1	P43005	524 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	NDST2	P52849	883 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	FGL2	Q14314	439 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	FZD2	Q14332	565 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	GUSBP11	Q6P575	273 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700		Q6ZSR6	202 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700		Q6ZVU0	165 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	CLEC14A	Q86T13	490 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	HORMAD1	Q86X24	394 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	MAPK15	Q8TD08	544 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ARRDC3	Q96B67	414 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	BTBD6	Q96KE9	485 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ABCG4	Q9H172	646 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	NEU3	Q9UQ49	428 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	POM121B	A6NF01	834 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	NEMP2	A6NFY4	417 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	RASA4B	C9J798	803 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	RASA4	O43374	803 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	BUB1	O43683	1085 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	KDELR3	O43731	214 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	NRDC	O43847	1150 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	NOBOX	O60393	691 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	MTA2	O94776	668 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	LCA5L	O95447	670 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	CSF2	P04141	144 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	RARA	P10276	462 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ERCC2	P18074	760 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	GJC1	P36383	396 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ACVRL1	P37023	503 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	DNA2	P51530	1060 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	CDH6	P55285	790 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	GSDMD	P57764	484 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ARF5	P84085	180 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	RAD51	Q06609	339 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	MESD	Q14696	234 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	PDK2	Q15119	407 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	CA9	Q16790	459 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	HS1BP3	Q53T59	392 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	COLEC12	Q5KU26	742 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	PERM1	Q5SV97	790 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	LINGO4	Q6UY18	593 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	CALN1	Q9BXU9	219 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	SP110	Q9HB58	689 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	STARD5	Q9NSY2	213 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700		K7ERQ8	282 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	RAD51B	O15315	384 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	SPINT1	O43278	529 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ZMPSTE24	O75844	475 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	NDUFA10	O95299	355 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	IGSF6	O95976	241 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	GSR	P00390	522 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	ALPPL2	P10696	532 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	FECH	P22830	423 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	IL1R2	P27930	398 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NUMB-222	ENST00000556700	AKT2	P31751	481 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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