RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512656.1

USP46-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 3

Gene USP46, Length 467 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-208ENST00000512656 ZYG11BQ9C0D3 744 aa7.32□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 USP29Q9HBJ7 922 aa7.32□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 ATP13A1Q9HD20 1204 aa7.32□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 PLCB1Q9NQ66 1216 aa7.32□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 MPP6Q9NZW5 540 aa7.32□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 IL36AQ9UHA7 158 aa7.32□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.32□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.32□□□□□ -1.24
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USP46-208ENST00000512656 A0A1W2PPZ6 126 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 A6NNZ2 444 aa7.31□□□□□ -1.24
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USP46-208ENST00000512656 K7ERQ8 282 aa7.31□□□□□ -1.24
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USP46-208ENST00000512656 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 AP1G1O43747 822 aa7.31□□□□□ -1.24
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USP46-208ENST00000512656 LEFTY1O75610 366 aa7.31□□□□□ -1.24
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USP46-208ENST00000512656 CTSLP07711 333 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 TPM2P07951 284 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 GLDCP23378 1020 aa7.31□□□□□ -1.24
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USP46-208ENST00000512656 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 DNA2P51530 1060 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 GSTM4Q03013 218 aa7.31□□□□□ -1.24
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USP46-208ENST00000512656 SGCGQ13326 291 aa7.31□□□□□ -1.24
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USP46-208ENST00000512656 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 TAF3Q5VWG9 929 aa7.31□□□□□ -1.24
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USP46-208ENST00000512656 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa7.31□□□□□ -1.24
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USP46-208ENST00000512656 SLC25A45Q8N413 288 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 CHST14Q8NCH0 376 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 OR4C6Q8NH72 309 aa7.31□□□□□ -1.24
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USP46-208ENST00000512656 TSPAN6O43657 245 aa7.3□□□□□ -1.24
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USP46-208ENST00000512656 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 MIIPQ5JXC2 388 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 NAA35Q5VZE5 725 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 PAOXQ6QHF9 649 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 TRIM72Q6ZMU5 477 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-208ENST00000512656 GCNT7Q6ZNI0 430 aa7.3□□□□□ -1.24
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