RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-241	ENST00000496183	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ACE	P12821	1306 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	BCL9	O00512	1426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	LDB2	O43679	373 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	CLDN7	O95471	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	CKMT1A	P12532	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	PMS2	P54278	862 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RHBDL3	P58872	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	CRB1	P82279	1406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	LHPP	Q9H008	270 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	USP6	P35125	1406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183		A0A0A0MQY5	61 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	SOX30	O94993	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	MTNR1A	P48039	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	PEX5	P50542	639 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ST3GAL1	Q11201	340 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	PKP1	Q13835	747 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	POSTN	Q15063	836 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	EVC2	Q86UK5	1308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	SLIT3	O75094	1523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	EP400	Q96L91	3159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	SERPINC1	P01008	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	DAO	P14920	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RXRA	P19793	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	MYF6	P23409	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	HNF4G	Q14541	408 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RNF183	Q96D59	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	RREB1	Q92766	1687 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	CCDC7	Q96M83	1385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-241	ENST00000496183	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-241	ENST00000496183	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-241	ENST00000496183	CHL1	O00533	1208 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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