RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469980.1

BBS5-204, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 5, humanhuman

TSL 4

Gene BBS5, Length 593 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS5-204ENST00000469980 ITPKBP27987 946 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 PCK1P35558 622 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 GJC1P36383 396 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 MMP12P39900 470 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 TAS2R40P59535 323 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 FOXK1P85037 733 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 RALGDSQ12967 914 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 SGCGQ13326 291 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 C1orf61Q13536 156 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 NFKBIBQ15653 356 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 DEFB133Q30KQ1 61 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 TMEM52BQ4KMG9 183 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 POLNQ7Z5Q5 900 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 PELI3Q8N2H9 469 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 PLA2G15Q8NCC3 412 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 OR4C6Q8NH72 309 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 CXorf40AQ8TE69 158 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 TRIM11Q96F44 468 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 SMIM14Q96QK8 99 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 SUV39H2Q9H5I1 410 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 SP110Q9HB58 689 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 DKK3Q9UBP4 350 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 RAI2Q9Y5P3 530 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 HECTD1Q9ULT8 2610 aa10□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 SPTA1P02549 2419 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 A0A0U1RQS6 177 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 H3BRJ5 948 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 MFSD11O43934 449 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 GCATO75600 419 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 TM7SF2O76062 418 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 MAP3K6O95382 1288 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 CSF2P04141 144 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 JUNDP17535 347 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 DESP17661 470 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 IL4RP24394 825 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 ACP1P24666 158 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 RABIFP47224 123 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 HCAR3P49019 387 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 LIG3P49916 1009 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 MAXP61244 160 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 TPM4P67936 248 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 IHHQ14623 411 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 UGP2Q16851 508 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 CCDC122Q5T0U0 273 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 ZNF605Q86T29 641 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 PARGQ86W56 976 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 TMPRSS12Q86WS5 348 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 ZNF843Q8N446 348 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 NIPA2Q8N8Q9 360 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 RNF214Q8ND24 703 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 DENND6BQ8NEG7 585 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 LMX1AQ8TE12 382 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 ASB12Q8WXK4 309 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 APOLD1Q96LR9 279 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 LRRC61Q9BV99 259 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 CLPBQ9H078 707 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 OR1A2Q9Y585 309 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 PTPN13Q12923 2485 aa9.99□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 MAFKO60675 156 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 PCCBP05166 539 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 JUPP14923 745 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 XPAP23025 273 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 HNF1BP35680 557 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 SCNN1BP51168 640 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 ARSEP51690 589 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 CDH6P55285 790 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 DAB2P98082 770 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 RAD51Q06609 339 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 IL10RBQ08334 325 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 GUSBP11Q6P575 273 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 TMCO3Q6UWJ1 677 aa9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
BBS5-204ENST00000469980 PHACTR4Q8IZ21 702 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms