RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX5P17844 614 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 IL1R2P27930 398 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CCR10P46092 362 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 NUMBP49757 651 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC36A3Q495N2 470 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 C17orf99Q6UX52 265 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GK5Q6ZS86 529 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 HAUS6Q7Z4H7 955 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CAMK1DQ8IU85 385 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC49Q8IUZ0 686 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PARP8Q8N3A8 854 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKFN1Q8N957 763 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ZUFSPQ96AP4 578 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CALN1Q9BXU9 219 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM50BQ9Y247 325 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PRORSD1PA6NEY8 169 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 H7C0C1 242 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 M0QX08 132 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CHADO15335 359 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TMCC2O75069 709 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC14L2O76054 403 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP5OP48047 213 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT6CP48668 564 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBA1BP68363 451 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM32Q13049 653 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PAGE2BQ5JRK9 111 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP4A22Q5TCH4 519 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 LAYNQ6UX15 382 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBA1AQ71U36 451 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MFSD2AQ8NA29 543 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TP53INP1Q96A56 240 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TXNDC15Q96J42 360 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 LXNQ9BS40 222 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP26B1Q9NR63 512 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DCDC2Q9UHG0 476 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa8.45□□□□□ -1.06
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RABGEF1-203ENST00000439720 SCO2O43819 266 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GAS7O60861 476 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ALX3O95076 343 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MFN2O95140 757 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CPNE6O95741 557 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHA2P01877 340 aa8.45□□□□□ -1.06
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RABGEF1-203ENST00000439720 ELK4P28324 431 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CHRNEQ04844 493 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 IKQ13123 557 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PICALMQ13492 652 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM110CQ1W6H9 321 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SMU1Q2TAY7 513 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MAJINQ3KP22 176 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.45□□□□□ -1.06
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RABGEF1-203ENST00000439720 OSCP1Q8WVF1 389 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FIG4Q92562 907 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SEPT8Q92599 483 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXL18Q96ME1 805 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
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RABGEF1-203ENST00000439720 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 HEATR9A2RTY3 570 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM172BPA6NC97 362 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK2AP1O14519 115 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNN4O15554 427 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 XYLBO75191 536 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TADA2AO75478 443 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 JUNP05412 331 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
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