RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 PBX1P40424 430 aa20.26■□□□□ 0.83
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HLA-B-250ENST00000434333 IL10RBQ08334 325 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 RALGDSQ12967 914 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 SLC35F3Q8IY50 421 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 MAPK15Q8TD08 544 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 DEPDC7Q96QD5 511 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 SP110Q9HB58 689 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.26■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 CPED1A4D0V7 1026 aa20.25■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 DFFAO00273 331 aa20.25■□□□□ 0.83
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HLA-B-250ENST00000434333 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
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HLA-B-250ENST00000434333 NR0B2Q15466 257 aa20.25■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 DPYSL2Q16555 572 aa20.25■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 ALG11Q2TAA5 492 aa20.25■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.25■□□□□ 0.83
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HLA-B-250ENST00000434333 FGF11Q92914 225 aa20.25■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 TRIM11Q96F44 468 aa20.25■□□□□ 0.83
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HLA-B-250ENST00000434333 PEX11BO96011 259 aa20.24■□□□□ 0.83
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HLA-B-250ENST00000434333 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.24■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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HLA-B-250ENST00000434333 SMTNL2Q2TAL5 461 aa20.24■□□□□ 0.83
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HLA-B-250ENST00000434333 USP12O75317 370 aa20.23■□□□□ 0.83
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HLA-B-250ENST00000434333 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.23■□□□□ 0.83
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HLA-B-250ENST00000434333 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.23■□□□□ 0.83
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HLA-B-250ENST00000434333 LBRQ14739 615 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
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HLA-B-250ENST00000434333 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.22■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 ENPP7Q6UWV6 458 aa20.22■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.22■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 HID1Q8IV36 788 aa20.22■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 SPOCK2Q92563 424 aa20.22■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF599Q96NL3 588 aa20.22■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.22■□□□□ 0.83
HLA-B-250ENST00000434333 PRORYQ9H606 182 aa20.22■□□□□ 0.83
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