RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375227.8

LLGL2-202, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LLGL2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2-202ENST00000375227 LIG3P49916 1009 aa22.37■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 SUOXP51687 545 aa22.37■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 WSCD2Q2TBF2 565 aa22.37■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 ERAP2Q6P179 960 aa22.37■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.37■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 RBFAQ8N0V3 343 aa22.37■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 OR4C6Q8NH72 309 aa22.37■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.37■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 IFT43Q96FT9 208 aa22.37■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa22.37■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa22.36■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 CAPNS1P04632 268 aa22.36■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 TPM1P09493 284 aa22.36■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 AP1S1P61966 158 aa22.36■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 MGME1Q9BQP7 344 aa22.36■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.36■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa22.35■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 TMEM8BA6NDV4 472 aa22.35■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 A8MX80 341 aa22.35■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 CKMT2P17540 419 aa22.35■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 RENBPP51606 427 aa22.35■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.178e-6■■■■□ 19.7
LLGL2-202ENST00000375227 MESDQ14696 234 aa22.35■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.35■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 KCTD6Q8NC69 237 aa22.35■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.35■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 CCDC42Q96M95 316 aa22.35■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 NOD2Q9HC29 1040 aa22.35■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 PKD1L2Q7Z442 2459 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 APC2O95996 2303 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 KNTC1P50748 2209 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 TAF4O00268 1085 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 JUNDP17535 347 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 GM2AP17900 193 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 THOP1P52888 689 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 TRAF2Q12933 501 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 CAMK2BQ13554 666 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 LRRC14Q15048 493 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 GALNT15Q8N3T1 639 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 PQLC3Q8N755 202 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 PAF1Q8N7H5 531 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 MDM1Q8TC05 714 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 RAPGEF5Q92565 580 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 ZNF670Q9BS34 389 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 U3KQA8 63 aa22.34■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 K7ESM1 405 aa22.33■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 SCAMP1O15126 338 aa22.33■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 ACP1P24666 158 aa22.33■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 MAN1A1P33908 653 aa22.33■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 MMP13P45452 471 aa22.33■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 GALNT2Q10471 571 aa22.33■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 SARM1Q6SZW1 724 aa22.33■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 DPPA4Q7L190 304 aa22.33■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 PLA2G15Q8NCC3 412 aa22.33■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 FAF2Q96CS3 445 aa22.33■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.33■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 NLGN3Q9NZ94 848 aa22.33■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.33■■□□□ 1.17
LLGL2-202ENST00000375227 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 H3BM21 787 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 PCCBP05166 539 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 GARSP41250 739 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 DAB2P98082 770 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 GBE1Q04446 702 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 C1orf61Q13536 156 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 PDK2Q15119 407 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 PTPRRQ15256 657 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 HES3Q5TGS1 186 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 MARC1Q5VT66 337 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 KCTD16Q68DU8 428 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 LIPIQ6XZB0 460 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 MACC1Q6ZN28 852 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 CNGA4Q8IV77 575 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 PHACTR4Q8IZ21 702 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 LMX1AQ8TE12 382 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 APOLD1Q96LR9 279 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 TRIM5Q9C035 493 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 NT5MQ9NPB1 228 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 OR1A2Q9Y585 309 aa22.32■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 AQP9O43315 295 aa22.31■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 GCATO75600 419 aa22.31■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
LLGL2-202ENST00000375227 KRT7P08729 469 aa22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms